姚宗洪;吴振科;卡提克·巴拉斯;李金菊;维拉巴德兰·巴拉丹达尤塔帕尼 癌症治疗树的概率学习。 （英语） Zbl 07789363号 附录申请。斯达。 17，第3期，1884-1908（2023）. 摘要：准确识别协同治疗组合及其潜在的生物机制对于许多疾病领域，尤其是癌症来说至关重要。在转化肿瘤学研究中，临床前系统，如患者衍生异种移植物（PDX），已成为一种独特的研究设计，用于评估将同一人类肿瘤的样本移植到基因相同的小鼠体内的多重治疗。在本文中，我们提出了一种新的基于贝叶斯概率树的PDX数据框架，通过推断处理聚类树来研究处理之间的层次关系，称为处理树\（\ operatorname{右}_{\operatorname{x}}\）-树）。该框架激发了两个或多个处理之间机械相似性的新度量，解释了树估计的固有不确定性；具有高估计相似性的处理具有潜在的高机械协同作用。基于Dirichlet扩散树，我们推导出了一个封闭形式的边缘似然，对树结构进行编码，这有助于通过一个新的两阶段算法进行高效的后验推理。仿真研究表明，该方法在恢复树结构和处理相似性方面具有优越的性能。我们对最近整理的PDX数据集进行了分析，得出了治疗相似性估计值，该估计值与五种不同癌症治疗的已知生物学机制高度一致。更重要的是，我们发现了新的和潜在有效的联合疗法，为未来的临床研究提供了对特定下游生物途径的协同调节。我们附带的用于结果可视化的代码、数据和闪亮应用程序位于：https://github.com/bayesrx/RxTree. MSC公司： 62件 统计学的应用 关键词：近似贝叶斯计算;Dirichlet扩散树;病人来源的异种移植物;精密医学;基于树的聚类 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{T.-H.Yao}等人，Ann.Appl。Stat.17，No.3，1884--1908（2023；Zbl 07789363） 全文： DOI程序 arXiv公司 参考文献： [1] ABDOLAHI S.、GHAZVINIAN Z.、MUHAMMADNEJAD S.、SALEH M.、AGHDAEI H.A.和BAGHAEI K.（2022年）。患者衍生异种移植（PDX）模型，在癌症研究中的应用和挑战。J.翻译。医学20 206。数字对象标识符：10.1186/s12967-022-03405-8谷歌学者：查找链接·doi:10.1186/s12967-022-03405-8 [2] 巴尔科·J·M、米勒·T·W、莫里森·M·M、哈金森·K、杨·C、里恩哈特·C、S·NCHEZ·V、JEE·D、波利亚克·K等人（2012年）。受体酪氨酸激酶ErbB3维持管腔和基底乳腺上皮之间的平衡。程序。国家。阿卡德。科学。美国109 221-226。 [3] BAYAT MOKHTARI，R.、HOMAYOUNI，T.S.、BALUCH，N.、MORGATSKAYA，E.、KUMAR，S.、DAS，B.和YEGER，H.（2017年）。联合治疗抗癌。Oncotarget公司8 38022-38043. [4] BERTOTTI，A.、MIGLIARDI，G.、GALIMI，F.、SASSI，F.，TORTI，D.、ISELLA，C.、COR al，D.、DI NICOLANTONIO，F.和BUSCARINO，M.等人（2011年）。一个患者衍生异种移植物（“异种患者”）的分子注释平台将HER2确定为西妥昔单抗耐药结直肠癌的有效治疗靶点。癌症发现。1 508-523. 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