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基于持久同源性的乳腺癌免疫微环境表征:一项可行性研究。 (英语) Zbl 07760140号

Cabello,Sergio(编辑)等人,第36届计算几何国际研讨会,SoCG 2020,瑞士苏黎世(虚拟会议),2020年6月23日至26日。诉讼程序。Wadern:达格斯图尔宫——莱布尼茨Zentrum für Informatik。LIPIcs–莱布尼茨国际程序。通知。164,第11条,第20页(2020年)。
摘要:持久同调是拓扑数据分析的常用工具,其主要描述符持久图旨在计算和编码给定数据集的几何和拓扑。在本文中,我们提出了持久同源性的新应用,以表征乳腺癌免疫微环境中免疫细胞和上皮(肿瘤)细胞的空间排列。更具体地说,通过使用染色技术(定量多重免疫荧光)计算持久性图来建立定量和稳健的特征,染色技术允许我们获得单个细胞的空间坐标和染色强度。由此产生的持续性图被评估为癌症亚型的特征生物标记物和总体生存的预后生物标记物。对于大约700名乳腺癌患者的队列,中位随访时间为8.5年,我们发现这些持续性图表优于并补充了常用的描述符,这些描述符通过最近邻分析捕捉空间关系。这为构建(基于拓扑的)生物标记物的一般问题提供了新的见解和可能性,这些生物标记物具有癌症亚型、总体生存率和治疗反应的特征和预测性。
关于整个系列,请参见[Zbl 1436.68018号].

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05年6月 计算机图形;计算几何(数字和算法方面)
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全文: 内政部