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糖酵解结构设计的动力学和热力学约束。 (英语) Zbl 0891.92014号

摘要:糖酵解是代谢系统数学建模领域的热门课题之一。已经开发了不同类型的模拟模型,例如,a)基于单个酶的非常详细的动力学描述的模型,b)“骨架”模型和c)用于简化准静态近似的模型。本研究的目的与仿真模型的目的大不相同。它试图解释糖酵解的某些结构特征,这些结构特征在生物体的生命周期中是固定的,但在进化时间尺度中发生了变化。
关于代谢途径结构设计的研究通常基于这样的假设,即在进化过程中,已经选择了具有某些最佳特性的系统。相关优化标准为:稳态通量最大化、代谢途径瞬态时间最小化、中间体总渗透压最小化、化学计量简单化和热力学效率最大化。根据糖酵解的主要生物学功能是生成ATP这一事实,我们的兴趣集中在最大ATP生成率的优化原则对糖酵化结构设计的影响上。特别是,我们关注ATP产生和消费位点在糖酵解链上的数量和位置的最佳分布。

MSC公司:

92C45型 生化问题中的动力学(药代动力学、酶动力学等)
49号70 差异化游戏和控制
49N75号 追逃小游戏
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全文: 内政部

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