卢卡·博托卢西;弗朗西丝卡·凯罗利 马尔可夫人口模型的贝叶斯抽象。 （英语） Zbl 07817526号 Parker，David（编辑）等人，《系统的定量评估》。2019年9月10日至12日在英国格拉斯哥举行的2019年QEST第16届国际会议。诉讼程序。查姆：斯普林格。莱克特。注释计算。科学。11785, 259-276 (2019). 摘要：马尔可夫种群模型是一种广泛应用的形式主义，在系统生物学、性能评价、生态学等许多领域都有应用。连续时间内相关的马尔可夫随机过程通常通过仿真进行分析，这对于大型或刚性系统来说可能代价高昂，尤其是当仿真必须在多尺度模型中进行时（例如，模拟组织中的单个细胞）。减少计算负荷的一种策略是抽象人口模型，用更简单的随机模型代替它，以更快地进行模拟。在这里，我们在先前工作的基础上继续追求这个想法[博托鲁西乳杆菌和L.帕尔米耶里，莱克特。注释计算。科学。11095, 21–38 (2018;Zbl 1397.92272号)]以及在连续空间和离散时间中构造马尔可夫过程的近似核，捕获固定时间步长的演化。该内核是从原始模型的模拟中自动学习的。与依赖深度神经网络的[loc.cit.]不同，我们在这里探索了一种基于Dirichlet过程的贝叶斯密度回归方法，它提供了一种估计不确定性的原则方法。关于整个系列，请参见[Zbl 1419.68016号]. MSC公司： 92D25型 人口动态（概述） 60J28型 连续时间Markov过程在离散状态空间中的应用 92天30分 流行病学 关键词：模型抽象;马尔可夫人口模型;贝叶斯密度回归;Dirichlet过程 引文：Zbl 1397.92272号 软件：贝叶斯DA;斯托奇Py PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{L.Bortolussi}和\textit{F.Cairoli}，莱克特。注释计算。科学。11785、259--276（2019；Zbl 07817526） 全文： 内政部 链接 参考文献： [1] Barber，D.：贝叶斯推理与机器学习。剑桥大学出版社，剑桥（2012） [2] Bodei，C.，Bortolussi，L.，Chiarugi，D.，Guerriero，M.L.，Policiti，A.，Romanel，A.：关于离散性和抽象性对基因调控网络中建模噪声的影响。计算。生物化学。56, 98-108 (2015) [3] Bortolussi，L.，Palmieri，L.：化学反应网络的深层抽象。收录于：乔什卡，M.，Šafránek，D.（编辑）CMSB 2018。LNCS，第11095卷，第21-38页。查姆施普林格（2018）。https://doi.org/10.1007/978-3-319-99429-1_2 [4] Cao，Y.，Petzold，L.：化学反应系统随机模拟中的精度限制和误差测量。J.计算。物理学。212(1), 6-24 (2006) [5] Deisboeck，T.S.，Wang，Z.，Macklin，P.，Cristini，V.：多尺度癌症建模。每年。生物识别版本。《工程》13（1），127-155（2011）。https://doi.org/10.1146/annurev-bioeng-071910-124729 [6] 邓森，D.B.：经验贝叶斯密度回归。《中国统计》17（2），481（2007） [7] Dunson，D.B.，Pillai，N.，Park，J.H.：贝叶斯密度回归。J.罗伊。Stat.Soc.：序列号。B（Stat.Methodol.）69（2），163-183（2007） [8] Ferguson，T.S.：一些非参数问题的贝叶斯分析。Ann.Stat.1209-230（1973） [9] Gelman，A.，Stern，H.S.，Carlin，J.B.，Dunson，D.B.，Vehtari，A.，Rubin，D.B.：贝叶斯数据分析。查普曼和霍尔/CRC，博卡拉顿（2013） [10] Gillespie，D.T.，Petzold，L.：生化动力学的数值模拟。摘自：Szallasi，Z.、Stelling，J.、Periwal，V.（编辑）《细胞生物学中的系统建模》，第331-354页。麻省理工学院出版社，剑桥（2006） [11] Ishwaran，H.，James，L.F.：破胶前期的吉布斯取样方法。《美国统计协会期刊》96（453），161-173（2001） [12] Maarleveld，T.R.，Olivier，B.G.，Bruggeman，F.J.：Stochpy：模拟随机生物过程的综合、用户友好工具。公共科学图书馆ONE 8（11），e79345（2013） [13] Michaelides，M.，Hillston，J.，Sanguinetti，G.：多尺度时空系统的统计抽象。收录：Bertrand，N.，Bortolussi，L.（编辑）QEST 2017。LNCS，第10503卷，第243-258页。查姆施普林格（2017）。https://doi.org/10.1007/978-3-319-66335-7_15 [14] Norris，J.R.：马尔可夫链。剑桥大学出版社，剑桥（1998） [15] Nott，D.J.，Tan，S.L.，Villani，M.，Kohn，R.：用变分方法和随机近似进行回归密度估计。J.计算。图表。Stat.21（3），797-820（2012） [16] Palaniappan，S.K.，Bertaux，F.，Pichene，M.，Fabre，E.，Batt，G.，Genest，B.：利用信息理论抽象生物路径的动力学。生物信息学331980-1986（2017） [17] Sethuraman，J.：迪里克莱先验的建设性定义。《中国统计》4639-650（1994） 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。