乔治·哈恩;沙伦·卢茨（Sharon M.Lutz）。;尼兰加纳·拉哈;Cho，Michael H。;埃德温·西尔弗曼。;克里斯托夫·兰格 拉索回归的快速有效平滑方法及其在统计遗传学中的应用：慢性阻塞性肺疾病（COPD）的多基因风险评分。 （英语） Zbl 1475.62034号 统计计算。 31，第3号，第35号论文，第11页（2021年）. 摘要：高维线性回归问题通常使用拉索方法拟合。尽管Lasso目标函数是凸的，但它不是处处可微的，这使得使用梯度下降方法进行最小化并不简单。为了避免此技术问题，我们将Nesterov平滑应用于原始（未平滑）Lasso目标函数。我们引入了一个封闭形式的光滑拉索函数，它保持了拉索函数的凸性，一致地接近于非光滑拉索，并允许我们通过梯度下降在任何地方获得封闭形式的导数，从而实现高效快速的最小化。我们的模拟研究重点是使用来自慢性阻塞性肺病（COPD）全基因组关联研究（GWAS）的遗传数据进行多基因风险评分。我们将该方法的准确性和运行时间与文献中的当前黄金标准FISTA算法进行了比较。我们的结果表明，与FISTA算法相比，该方法提供的估计具有相同或更高的精度，同时具有相同的渐近运行时缩放。建议的方法在R包中实施平滑拉索，可在综合R档案网络（CRAN）上获得。 理学硕士： 62-08 统计问题的计算方法 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 62J07型 岭回归；收缩估计器（拉索） 关键词：慢性阻塞性肺病;FISTA公司;拉索;内斯特罗夫;惩罚线性回归;多基因风险评分;平滑的 软件：美国金融服务贸易协会;平滑拉索;R（右） PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{G.Hahn}等人，《统计计算》。31，第3号，第35号论文，第11页（2021年；Zbl 1475.62034） 全文： 内政部 内政部 参考文献： [1] 贝克，A。；Teboulle，M.，线性反问题的快速迭代收缩阈值算法，SIAM成像科学杂志。，183-202年2月1日（2009年）·Zbl 1175.94009号 ·doi:10.1137/080716542 [2] Chi，E.，Goldstein，T.，Studer，C.，Baraniuk，R.：fasta：快速自适应收缩/阈值算法。R-package版本1（2018） [3] Daubechies，I。；Defrise，M。；Mol，C.，具有稀疏约束的线性反问题的迭代阈值算法，Commun。纯应用程序。数学。，57, 11, 1413-1457 (2004) ·Zbl 1077.65055号 ·doi:10.1002/cpa.20042 [4] 埃夫隆，B。；哈斯蒂，T。；约翰斯通，I。；Tibshirani，R.，《最小角度回归》，《Ann.Stat.》，32，2，407-499（2004）·Zbl 1091.62054号 ·doi:10.1214/009053604000000067 [5] 范，J。；Li，R.，《通过非一致惩罚似然进行变量选择及其预言属性》，美国统计协会，96，456，1348-1360（2001）·Zbl 1073.62547号 ·doi:10.1198/016214501753382273 [6] 弗里德曼，J。；哈斯蒂，T。；Tibshirani，R.，通过坐标下降的广义线性模型的正则化路径，J.Stat.Softw。，33, 1, 1-22 (2010) ·doi:10.18637/jss.v033.i01 [7] Hahn，G.，Banerjee，M.，Sen，B.：连续分段线性回归模型中的参数估计和推断（2017）。http://www.cantab.net/users/ghahn/prints/PhaseRegMultiDim.pdf。2017年3月21日访问 [8] Hahn，G.，Lutz，S.M.，Laha，N.，Lange，C.：平滑LASSO：通过Nesterov平滑平滑LASSO回归。R-package版本1.3（2020）。https://cran.r-project.org/package=smooledLasso。访问日期：2017年3月21日 [9] Hastie，T.，Efron，B.：lars：最小角度回归，套索和向前分段。R-package版本1.2（2013） [10] Khera，A.V.，Chaffin，M.，Aragam，K.G.，Haas，M.E.，Roselli，C.，Choi，S.H.，Natarajan，P.，Lander，E.S.，Lubitz，S.A.，Ellinor，P.T.，Kathiresan，S.：常见疾病的全基因组多基因评分确定了具有单基因突变风险的个体。自然基因。50, 1219-1224 (2018) [11] Mak，T。；Porsch，R。；Choi，S。；周，X。；Sham，P.，通过汇总统计的惩罚回归得出的多基因得分，Genet。流行病。，41, 6, 469-480 (2016) ·doi:10.1002/gepi.22505 [12] Michelot，C.，求点在\（mathbb{R}^n）的规范单纯形上的投影的有限算法，J.Optim。理论应用。，50, 1, 195-200 (1986) ·Zbl 0571.90074号 ·doi:10.1007/BF00938486 [13] Nesterov，Y.，求解具有收敛速度的凸规划问题的一种方法\（O（1/k^2）\），Dokl。阿卡德。诺克SSSR，269，3543-547（1983）·Zbl 0535.90071号 [14] Nesterov，Y.，非光滑函数的平滑最小化，数学。程序。序列号。A、 103、127-152（2005）·Zbl 1079.90102号 ·doi:10.1007/s10107-004-0552-5 [15] NHLBI TOPMed：美国国家心脏、肺和血液研究所（NHLBI）Trans-Omics for Precision Medicine（TOPMed）计划中的波士顿早期COPD研究（2018年）。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi？study_id=phs000946.v3.p1。2016年10月18日访问 [16] R核心团队：R：统计计算语言和环境。奥地利维也纳R统计公司基金会（2014年）。http://www.R-project.org/。2019年9月2日访问 [17] 里根，E。；霍坎森，J。；J.墨菲。；品牌，B。；林奇，D。；Beaty，T。；Curran-Everett，D。；西尔弗曼，E。；Crapo，J.，慢性阻塞性肺病（copdgene）的遗传流行病学研究设计2，copd，7，32-43（2010）·doi:10.10109/115412550903499522 [18] Tibshirani，R.，《通过套索进行回归收缩和选择》，J.R.Stat.Soc.B Methodol。，58, 1, 267-288 (1996) ·Zbl 0850.62538号 [19] Tibshirani，R.：模型选择和验证1:交叉验证（2013）。网址：https://www.stat.cmu.edu/ryantibs/数据挖掘/讲座/18-val1.pdf。2019年9月2日访问 [20] Wu，T。；陈，Y。；哈斯蒂，T。；索贝尔，E。；Lange，K.，拉索惩罚逻辑回归的全基因组关联分析，生物信息学，25，6，714-721（2009）·doi:10.1093/bioinformatics/btp041 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。