玛丽·查文特;瓦妮莎·昆兹·西蒙特;阿默里·拉本内;杰罗姆·萨拉科 ClustGeo：具有空间约束的层次聚类的R包。 （英语） Zbl 1417.62006年 计算。斯达。 第4期第33号，1799-1822（2018）. 摘要：在本文中，我们提出了一种包含空间/地理约束的Ward-like层次聚类算法。输入了两个不同矩阵（D_0）和（D_1），以及一个混合参数（[0,1]\中的alpha）。差异可以是非欧几里德的，观测值的权重可以是非均匀的。第一个矩阵给出“特征空间”中的差异，第二个矩阵给出了“约束空间”中差异。每个阶段最小化的准则是用（D_0）计算的均匀准则和用（D_1）计算出的均匀准则的凸组合。其思想是根据感兴趣的变量（即特征空间的变量）确定一个值\（\alpha\），该值可以增加空间邻接度，而不会过度恶化解的质量。使用R包ClustGeo在实际数据集上演示了此过程。 引用于10文件 MSC公司： 62-04 有关统计问题的软件、源代码等 62H30型 分类和区分；聚类分析（统计方面） 关键词：病房式层次聚类;软邻接约束;假惯性;非欧几里德差异;地理距离 软件：BALD公司;ClustGeo公司;常量集群;地质簇;X光文字;群集Py;对 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit｛M.Chavent｝等人，计算。Stat.33，No.4，1799--1822（2018；Zbl 1417.62006） 全文： DOI程序 arXiv公司 参考文献： [1] Ambroise C，Govaert G（1998）空间聚类EM型算法的收敛性。模式识别Lett 19（10）：919-927·doi:10.1016/S0167-8655（98）00076-2 [2] 安布罗斯，C。；Dang，M。；戈沃特，G。；苏亚雷斯，A.（编辑）；Gómez-Hernandez，J.（编辑）；Froidevaux，R.（编辑），《利用EM算法对空间数据进行聚类》，493-504（1997），柏林·doi:10.1007/978-94-017-1675-8_40 [3] Bécue-Bertaut M，Kostov B，Morin A，Naro G（2014）《法庭演讲中的修辞策略：基于多维统计的方法论》。J类31（1）：85-106·Zbl 1360.68863号 ·doi:10.1007/s00357-014-9148-9 [4] Bécue-Bertaut M，Alvarez-Esteban R，Sánchez-Espigares JA（2017）Xplortext：文本数据R包的统计分析。R软件包版本1.0。https://cran.r-project.org/package=Xplortext。2017年10月26日访问 [5] Bourgault G，Marcotte D，Legendre P（1992）多元（co）变异函数作为分类方法中的空间加权函数。数学地理24（5）：463-478·doi:10.1007/BF00890530 [6] Chavent M、Kuentz-Simonet V、Labenne A、Saracco J（2017）《ClustGeo:具有空间约束的层次聚类》。R包版本2.0。https://cran.r-project.org/package=ClustGeo。2017年7月14日访问·Zbl 1417.62006年 [7] Dehman A，Ambroise C，Neuvial P（2015）利用连锁不平衡信息进行变量选择的分块方法表现。BMC生物信息16:148·doi:10.1186/s12859-015-0556-6 [8] Duque JC、Dev B、Betancourt A、Franco JL（2011）ClusterPy：空间约束聚类算法库，RiSE-group（空间经济学研究）。EAFIT大学。版本0.9.9。http://www.rise-group.org/risem/clusterpy/。2017年7月19日访问 [9] Ferligoj A，Batagelj V（1982）带关系约束的聚类。《心理测量学》47（4）：413-426·兹伯利0568.62059 ·doi:10.1007/BF02293706 [10] Gordon AD（1996）约束分类调查。计算机统计数据分析21:17-29·Zbl 0900.62313号 ·doi:10.1016/0167-9473（95）00005-4 [11] Lance GN，Williams WT（1967）分类排序策略的一般理论。1.等级制度。计算J 9:373-380·doi:10.1093/comjnl/9.4.373 [12] Legendre P（2014）const.clust:空间和时间受限的聚类包。http://adn.biol.umontreal.ca/数字生物学/Rcode。2014年3月30日访问 [13] 勒让德P，勒让德L（2012）《数值生态学》，第24卷。纽约爱思唯尔·Zbl 1033.92036号 [14] Miele V，Picard F，Dray S（2014）生态网络的空间约束聚类。方法Ecol Evol5（8）：771-779·doi:10.1111/2041-210X.12208 [15] Murtagh F（1985a）多维聚类算法。Compstat讲座。维也纳Physika·Zbl 0601.62085号 [16] Murtagh F（1985b）邻接约束聚类算法及相关问题综述。计算J 28:82-88·doi:10.1093/comjnl/28.182 [17] Oliver M，Webster R（1989）多元分类中空间权重的地质统计学基础。数学地理21（1）：15-35·doi:10.1007/BF00897238 [18] Strauss T，von Maltitz MJ（2017）《曼哈顿距离的概括病房法》。公共服务一号。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0168288 ·doi:10.1371/journal.pone.0168288 [19] Vignes M，Forbes F（2009），通过结合个体和成对特征的集成马尔可夫模型进行基因聚类。IEEE/ACM Trans-Comput Biol Bioninform（TCBB）6（2）：260-270·doi:10.1109/TCBB.2007.70248 [20] Ward JH Jr（1963）优化目标函数的分层分组。美国统计协会杂志58（301）：236-244·doi:10.1080/016214591963.10500845 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。