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信号通路的声明性观点。 (英语) Zbl 1443.92092号

Bodei,Chiara(编辑)等人,《生物和安全应用编程语言》。在皮耶保罗·德加诺65岁生日之际,为他撰写的论文。查姆:斯普林格。莱克特。注释计算。科学。9465, 183-201 (2015).
摘要:由于湿法技术的固有局限性,有关细胞信号通路的实验数据通常考虑单个通路或其中的一小部分。我们提出了一种在连贯框架中合成信号通路数据的方法。我们的方法是将信号通路指定为一个可计算执行的模型。我们依靠时间并发约束语言ntcc将手中的系统表示为一组类似化学计量的方程,类似于分子相互作用的基本特征。我们的方法的主要优势来自于约束(逻辑中的公式)的使用和离散时钟的建模ntcc(国家输电公司)我们可以处理部分信息,表示生物系统的几个特征可能尚未确定。我们可以明确表示反应发生所需的时间。我们对一些众所周知的交叉对话网络进行了建模和模拟,如TNF(α)、EGF和胰岛素信号通路及其相互作用。
关于整个系列,请参见[Zbl 1325.68011号]。

MSC公司:

92C40型 生物化学、分子生物学
92立方厘米 系统生物学、网络
92立方37 细胞生物学
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全文: 内政部

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