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隐马尔可夫随机场和斯堪的纳维亚棕熊种群的遗传结构。 (英语。法语摘要) Zbl 1441.62558号

摘要:当应用于等位基因频率的连续变化被小的不连续性破坏的群体时,空间贝叶斯聚类算法可以提供对群体遗传结构的正确推断。在这里,我们回顾了使用贝叶斯聚类算法研究斯堪的纳维亚棕熊的工作,特别是最近基于隐马尔可夫随机场的方法。我们总结了目前关于这一濒危种群遗传结构的知识,这些知识可能对其保护有用。

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62页第12页 统计在环境和相关主题中的应用
62H30型 分类和区分;聚类分析(统计方面)
62米05 马尔可夫过程:估计;隐马尔可夫模型
62立方米 空间过程推断

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参考文献:

[1] Blum,M.、Damerval,C.、Manel,S.和François,O.(2004)。布朗模型和凝聚结构。理论种群生物学65:249-261·Zbl 1109.92027号
[2] Corander,J.、Waldmann,P.和Sillanpää,M.(2003)。种群间遗传分化的贝叶斯分析。遗传学163:367-374。
[3] Dawson,K.和Belkhir,K.(2001年)。贝叶斯方法用于识别泛进化群体和分配个体。遗传学研究78:59-77。
[4] Destrempes,F.、Mignotte,M.和Angers,J.-F.(2005)。隐马尔可夫随机场模型贝叶斯估计的随机方法及其在颜色模型中的应用。IEEE图像处理汇刊14:1097-1108。
[5] François,O.、Ancelet,S.和Guillot,G.(2006年)。空间种群遗传学中使用隐马尔可夫随机场的贝叶斯聚类。遗传学174:805-816。
[6] Green,P.和Richardson,S.(2002年)。隐马尔可夫模型和疾病映射。美国统计协会杂志97(460):1055-1070·Zbl 1046.62117号
[7] Kimura,N.和Weiss,G.(1964年)。种群结构的垫脚石模型和遗传相关性随距离的减小。遗传学49:561-575。
[8] Malécot,G.(1948年)。《世界数学》。巴黎:马森·Zbl 0031.17304号
[9] Manel,S.、Bellemain,E.、Swenson,J.和François,O.(2004)假设和推断的种群空间结构:重新审视斯堪的纳维亚棕熊。分子生态学13:1327-1331。
[10] Manel,S.、Schwartz,M.、Luikart,G.和Taberlet,P.(2003)《景观遗传学:结合景观生态学和种群遗传学》。生态与进化趋势18(4):189-197。
[11] Preston,C.(1974)。可数集上的吉布斯态。剑桥:剑桥大学出版社·Zbl 0297.60054号
[12] Pritchard,J.、Stephens,M.和Donnelly,P.(2000)。利用多点基因型数据推断种群结构。遗传学155:945-959。
[13] 罗杰斯(1987)。食物供应和亲属关系对东北黑熊的社会行为、运动和种群动态的影响。明尼苏达州野生动物97:1-72。
[14] Serre,D.和Pääbo,S.(2004年)。大陆内部和大陆之间人类遗传多样性梯度的证据。基因组研究14:16791685。
[15] Swenson,J.、Sandegren,F.、Bjarvall,A.、Soderberg,A.、Wabakken,M.和Franzen,M..(1994)。瑞典棕熊(Ursus arctos)种群的大小、趋势、分布和保护。生物保护70:9-17。
[16] Swenson,J.E.、Sandegren,F.、Bjarvall,A.、Franzen,M.和Soderberg,A.(1995)。与挪威和瑞典的熊管理政策有关的斯堪的纳维亚棕熊濒临灭绝和恢复。野生生物1:11-25。
[17] Swenson,J.E.、Sandegren,F.和Soderberg,A.(1998年)。棕熊数量增加的地理扩张:饱和前扩散的证据。动物生态学杂志67:819-826。
[18] Taberlet,P.、Swenson,J.、Sandegren,F.和Bjarvall,A.(1995)。斯堪的纳维亚棕熊亚科熊两个高度分化的线粒体DNA谱系之间接触区的定位。保护生物学9:1255-1261。
[19] Waits,L.、Taberlet,P.、Swenson,J.、Sandegren,F.和Franzen,R.(2000)。斯堪的纳维亚棕熊Ursus arctos遗传多样性和基因流的核DNA微卫星分析。分子生态学9:610-621。
[20] Wright,S.(1943年)。通过距离隔离。遗传学28:114-138。
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