蒂莫塞·巴克里;Geir D.Berentsen。;简·布拉;索德雷·霍利兰 关于使用模板模型生成器的隐马尔可夫模型的加速参数和置信区间估计的温和教程。 （英语） Zbl 1523.62086号 生物。J。 64，编号7，1260-1288（2022）. 引用于1审查 MSC公司： 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 关键词：置信区间;隐马尔可夫模型;最大似然估计;TMB公司;辅导的 软件：R（右）;引导数据库;微基准;TMB公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{T.Bacri}等人，《生物》。京64，第7号，1260--1288（2022；Zbl 1523.62086） 全文： 内政部 arXiv公司 OA许可证 参考文献： [1] Ailliot，P.、Allard，D.、Monbet，V.和Naveau，P.（2015）。随机天气生成器：天气类型模型概述。法国社会统计杂志，156101-113·兹比尔1316.62163 [2] Bartolucci，F.、Farcomeni，A.和Pennoni，F.（2012年）。纵向数据的潜在马尔可夫模型。查普曼和霍尔/CRC社会和行为科学统计。泰勒和弗朗西斯。 [3] Baum，L.E.和Petrie，T.（1966年）。有限状态马尔可夫链概率函数的统计推断。《数理统计年鉴》，371554-1563·Zbl 0144.40902号 [4] Baum，L.E.、Petrie，T.、Soules，G.和Weiss，N.（1970年）。马尔可夫链概率函数统计分析中出现的一种最大化技术。《数理统计年鉴》，41，164-171·Zbl 0188.49603号 [5] Berentsen，G.D.、Bulla，J.、Maruotti，A.和Stöve，B.（2022年）。公司违约集群建模：制度转换模型显著降低了传染源。英国皇家统计学会杂志：C辑。https://rss.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/rssc.12551 [6] Bulla，J.和Berzel，A.（2008年）。平稳隐马尔可夫模型参数估计中的计算问题。计算统计学，23，1-18。 [7] Cappé，O.、Moulines，E.和Ryden，T.（2006年）。隐马尔可夫模型中的推断。施普林格科技与商业媒体。 [8] Celeux，G.和Durand，J.‐B。(2008). 选择具有交叉验证似然的隐马尔可夫模型状态数。计算统计学，23，541-564·兹比尔1224.62039 [9] Dempster，A.P.、Laird，N.M.和Rubin，D.B.（1977年）。通过EM算法从不完整数据中获得最大似然。英国皇家统计学会杂志：B辑（方法学），39，1-22·Zbl 0364.62022号 [10] Drton，M.和Plummer，M.（2017年）。奇异模型的贝叶斯信息准则。英国皇家统计学会杂志：B辑（统计方法），79，323-380·Zbl 1414.62088号 [11] Durbin，R.（1998）。生物序列分析：蛋白质和核酸的概率模型。剑桥大学出版社·Zbl 0929.92010号 [12] Eddy，S.R.（1998年）。描述隐藏马尔可夫模型。生物信息学，14755-763。 [13] Efron，B.和Tibshirani，R.J.（1993）。引导程序简介。查普曼和霍尔·Zbl 0835.62038号 [14] Feller，W.（1968年）。概率论及其应用简介。威利·兹伯利0155.23101 [15] Fischer，S.M.和Lewis，M.A.（2021年）。一种稳健且高效的算法，用于查找轮廓似然置信区间。统计与计算，31，38·Zbl 1475.62031号 [16] Fredkin，D.R.和Rice，J.A.（1992年）。单通道膜片钳记录的贝叶斯恢复。生物统计学，48427-448。 [17] Frühwirth‐Schnatter，S.（2006）。有限混合和马尔可夫切换模型。统计学中的斯普林格系列。Springer‐Verlag公司·Zbl 1108.6202号 [18] Gales，M.和Young，S.（2008年）。隐马尔可夫模型在语音识别中的应用。信号处理基础与趋势®，1195-304·Zbl 1145.68045号 [19] Gay，D.M.（1990年）。所选优化例程的使用摘要。计算机科学技术报告，153，1-21。 [20] Grimmett，G.、Grimmet，G.R.、Grymmet，P.o.M.S.G.、Stirzaker，D.和Stirzake，M.I.D.R.（2001）。概率和随机过程。牛津大学出版社·Zbl 0759.60002号 [21] Hamilton，J.D.（1989）。非平稳时间序列和经济周期经济分析的新方法。《计量经济学》，57，357-384·Zbl 0685.62092号 [22] Härdle，W.、Horowitz，J.和Kreiss，J.‐P。(2003). 时间序列的引导方法。《国际统计评论》，71，435-459·Zbl 1114.62347号 [23] Kass，R.E.和Steffey，D.（1989）。条件独立层次模型中的近似贝叶斯推断（参数经验贝叶斯模型）。美国统计协会杂志，84，717-726。 [24] Kristensen，K.、Nielsen，A.、Berg，C.W.、Skaug，H.和Bell，B.M.（2016）。TMB：自动微分和拉普拉斯近似。《统计软件杂志》，70，1-21。 [25] Leroux，B.G.和Puterman，M.L.（1992年）。独立和马尔可夫相关混合模型的最大惩罚似然估计。生物统计学，48545-558。 [26] Lystig，T.C.和Hughes，J.P.（2002年）。隐马尔可夫模型观测信息矩阵的精确计算。计算与图形统计杂志，11678-689。 [27] McClintock，B.T.、Langrock，R.、Gimenez，O.、Cam，E.、Borchers，D.L.、Glennie，R.和Patterson，T.A.（2020年）。用隐马尔可夫模型揭示生态状态动力学。《生态学快报》，1878-1903年第23期。 [28] McLachlan，G.J.和Peel，D.（2004）。有限混合模型。约翰·威利父子公司。 [29] Meeker，W.Q.和Escobar，L.A.（1995年）。基于最大似然估计的近似置信区域教学。《美国统计学家》，49，48-53。 [30] Mersmann，O.（2021）。微基准：精确的计时功能。R包版本1.4.9。 [31] Mor，B.、Garhwal，S.和Kumar，A.（2021）。系统回顾了隐马尔可夫模型及其应用。《工程计算方法档案》，第28期，1429-1448页。 [32] Pohle，J.、Langrock，R.、vanBeest，F.和Schmidt，N.M.（2017a）。选择隐马尔可夫模型中的状态数——陷阱、实际挑战和实用解决方案。https://arxiv.org/abs/1701.08673 [33] Pohle，J.、Langrock，R.、vanBeest，F.M.和Schmidt，N.M.（2017b）。选择隐藏马尔可夫模型中的状态数：使用动物运动说明的实用解决方案。农业、生物和环境统计杂志，22270-293·Zbl 1388.62349号 [34] Probst，T.、Pryss，R.、Langguth，B.和Schlee，W.（2016）。情绪动力学和耳鸣：来自“TrackYourTinnitus”应用程序的日常生活数据。科学报告，63116。 [35] Probst，T.、Pryss，R.C.、Langguth，B.、Rauschecker，J.P.、Schobel，J.、Reichert，M.、Spiliopoulou，M.，Schlee，W.和Zimmermann，J.（2017）。耳鸣是否取决于一天中的时间？使用“TrackYourTinnitus”应用程序进行的生态瞬时评估研究。衰老神经科学前沿，9253。 [36] Pryss，R.、Reichert，M.、Herrmann，J.、Langguth，B.和Schlee，W.（2015）。临床和心理试验中的移动人群感知——案例研究。2015年IEEE第28届基于计算机的医疗系统国际研讨会，IEEE，第23-24页。 [37] Pryss，R.、Reichert，M.、Langguth，B.和Schlee，W.（2015）。用于耳鸣评估、治疗和研究的移动人群感应服务。2015年IEEE移动服务国际会议，IEEE，第352-359页。 [38] R核心团队（2021年）。R： 用于统计计算的语言和环境。R统计计算基金会。 [39] Schadt，E.E.、Sinsheimer，J.S.和Lange，K.（1998年）。分子系统发育最大似然方法的计算进展。基因组研究，8222-233。 [40] Turner，R.（2008）。隐马尔可夫模型可能性的直接最大化。计算统计与数据分析，52，4147-4160·Zbl 1452.62606号 [41] Venzon，D.J.和Moolgavkar，S.H.（1988年）。一种计算基于剖面似然的置信区间的方法。英国皇家统计学会期刊：C系列（应用统计学），3787-94。 [42] Visser，I.、Raijmakers，M.E.J.和Molenaar，P.C.M.（2000）。隐马尔可夫模型参数的置信区间。英国数学与统计心理学杂志，53，317-327。 [43] Wald，A.（1943年）。当观测数量较大时，关于几个参数的统计假设检验。美国数学学会学报，54426-482·Zbl 0063.08120号 [44] Zucchini，W.、MacDonald，I.和Langrock，R.（2016）。时间序列的隐马尔可夫模型：使用R的简介（第二版）。查普曼和霍尔/CRC统计学与应用概率专著。CRC出版社·Zbl 1362.62005年 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。