Ctirad马托诺哈;帕帕切克，什蒂帕恩;沃洛德迈尔·林尼克 关于应用于一类化学反应网络的D-QSSA模型简化方法的常数延迟的最佳设置。 （英语） Zbl 07613025号 申请。数学。，普拉哈 67，第6号，831-857（2022）. 摘要：我们开发并测试了一种相对简单的经典模型简化方法的增强，该方法应用于一类具有质量守恒特性的化学网络。这两种方法，即（i）标准准静态近似方法，和（ii）新的所谓延迟准静态近似法，首先由T.韦乔茨克[Math.Bohem.139，第4期，577-585（2014；Zbl 1349.92030号)]，被广泛介绍。讨论了与时滞设置相关的理论和数值问题。也就是说，对于酶-底物反应网络的一个稍微修改的变体（Michaelis-Menten动力学），给出了完整的非还原系统行为与还原模型各自变体的比较，并对结果进行了讨论。最后，对延迟准静态近似方法的进一步应用进行了展望。 MSC公司： 92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等） 34A34飞机 非线性常微分方程和系统 65K10码 数值优化和变分技术 关键词：反应网络;模型简化;奇异摄动;准稳态近似;D-QSSA方法;优化 引文：Zbl 1349.92030号 软件：不明飞行物 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{C.Matonoha}等人，应用。数学。，普拉哈67，No.6，831--857（2022；Zbl 07613025） 全文： 内政部 参考文献： [1] 波尔，E。；Marek，I.，非线性合作系统的存在唯一性结果。线性算子和矩阵，算子理论：进展和应用130，153-170（2002），巴塞尔：Birkhäuser，巴塞尔·Zbl 1023.47052号 [2] 波尔，E。；Marek，I.，《生物和化学中的输入-输出系统以及描述它们的一类数学模型》，Appl。数学。，普拉哈，50，219-245（2005）·1099.34006兹比尔 [3] Briggs，G.E。；Haldane，J.B.S.，酶作用动力学注释，生物化学。J.，19333-339（1925年）·doi:10.1042/bj0190338 [4] Duintjer Tebbens，J。；马托诺哈，C。；马提奥斯，A。；Papáček，关于药物治疗中药物诱导酶产生的体外室模型中的参数估计，应用。数学。，普拉哈，64，253-277（2019）·Zbl 1524.92046号 [5] 艾勒特森，J。；Schnell，S.，《重温准静态近似：酶动力学中的时间尺度、小参数、奇点和正常形式》，数学。生物科学。，325, 20 (2020) ·Zbl 1448.92093号 ·doi:10.1016/j.mbs.2020.108339 [6] Flach，E.H。；Schnell，S.，准静态近似的使用和滥用，IEE Proc.-系统。生物学，153187-191（2006）·doi:10.1049/ip-syb:20050104 [7] 哈丁，H.M。；Zagaris，A。；Krab，K。；Westerhoff，H.V.，低底物浓度情况下简化但高度准确的酶动力学，FEBS J，2765491-5506（2009）·doi:10.1111/j.1742-4658.2009.07233.x号文件 [8] Isidori，A.，《非线性控制系统、通信和控制工程系列》（1995），柏林：施普林格出版社，柏林·Zbl 0878.93001号 [9] 哈利勒，香港，非线性系统（2002），《上鞍河：普伦蒂斯·霍尔》，上鞍河·Zbl 1003.34002号 [10] 新南威尔士州卢克。；De Vito，M.J。；沙阿一世。；El-Masri，H.A.，孕烷X受体（PXR）介导的异种代谢酶诱导定量模型的开发，公牛。数学。《生物学》，721799-1819（2010）·Zbl 1202.92029 ·doi:10.1007/s11538-010-9508-5 [11] 卢克桑，L。；Tůma，M。；马托诺哈，C。；弗切克，J。；Ramešová，北卡罗来纳州。；Šiška先生。；Hartman，J.，《2017年不明飞行物》。通用功能优化交互系统，技术报告V-1252（2017），普拉哈：中科院计算机科学研究所，普拉哈 [12] Marek，I.，《细胞生物学的一类随机模型：周期性和可控性》。积极系统，控制和信息科学讲稿，389359-367（2009）·Zbl 1182.93110号 ·doi:10.1007/978-3-642-02894-6_35 [13] 帕瓦切克；Lynnyk，V.，《准稳态假设与延迟准稳态假设：生化过程的模型简化工具》，第23届国际过程控制会议论文集，278-283（2021），丹佛：IEEE，丹佛 [14] Rehák，B.，《通过Razumikhin方法进行时滞系统的观测器设计》，亚洲J.Control，192226-2231（2017）·Zbl 1386.93057号 ·doi:10.1002/asjc.1507 [15] Rehák，B。；采利科夫斯克，S。；Ruiz-Leon，J。；Orozco-Mora，J.，两种基于FEM的非线性输出调节问题求解方法的比较，Kybernetika，45427-444（2009）·Zbl 1165.93320号 [16] Schnell，S.，Michaelis-Menten方程的有效性-稳态或反应物稳定假设：这是一个问题，FEBS J.，281464-472（2014）·doi:10.1111/febs.12564 [17] Segel，L.A.，关于酶动力学稳态假设的有效性，Bull。数学。生物学，50579-593（1988）·Zbl 0653.92006号 ·doi:10.1016/S0092-8240（88）80057-0 [18] 塞格尔，洛杉矶。；Slemrod，M.，《准静态假设：扰动案例研究》，SIAM Rev.，31446-477（1989）·Zbl 0679.34066号 ·数字对象标识代码：10.1137/1031091 [19] H.Smith：延迟微分方程简介及其在生命科学中的应用。应用数学课文57。施普林格，纽约，2011年·Zbl 1227.34001号 [20] 斯诺登，T.J。；范德格拉夫，P.H。；Tindall，M.J.，《大规模生物系统的模型简化方法：当前方法和趋势的调查》，布尔。数学。生物学，79，1449-1486（2017）·Zbl 1372.92033号 ·doi:10.1007/11538-017-0277-2 [21] Vejchodskí，T.，通过延迟准稳态假设精确还原昼夜节律模型，数学。波昂。，139, 577-585 (2014) ·兹比尔1349.92030 ·doi:10.21136/MB.2014.144135 [22] 韦乔德斯克，T。；Erban，R。；Maini，P.K.，《通过延迟准稳态假设减少化学系统》，26（2014） 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。