×

用星星盖住树。 (英语) Zbl 1328.90119号

摘要:我们研究了边删除和边插入作为编辑操作的树编辑距离(TED)问题。我们将这个问题的一个特例改写为用星覆盖树(CTS):给定一棵树(T)和一组星(mathcal{S}),我们可以通过在它们之间添加边来连接(mathcal{S})中的星,从而使生成的树与(T)同构吗?我们证明了在一般情况下,CST是NP-完全的,这意味着这里考虑的TED也是NP-hard,即使两个输入树的直径都以\(10)为界。我们还证明,当不同恒星的数量以常数\(k\)为界时,通过提出在\(O(|V(T)|^2 \cdot k\cdot|V(\mathcal{S})|^{2k})\)时间内运行的动态规划算法,CTS可以在多项式时间内求解。

MSC公司:

90C27型 组合优化
90立方厘米 动态编程
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: DOI程序

参考文献:

[1] Aho AV、Hopcroft JE、Ullman JD(1974)《计算机算法的设计与分析》。Addison-Wesley,阅读·Zbl 0326.68005号
[2] Akutsu T(2010)《树编辑距离问题:生物信息学的算法和应用》。IEICE传输信息系统93:208-218·doi:10.1587/transinf。E93.D.208号
[3] Akutsu T、Fukagawa D、Takasu A、Tamura T(2011)计算无序树之间树编辑距离的精确算法。计算机科学理论412(4-5):352-364·Zbl 1206.68224号 ·doi:10.1016/j.tcs.2010.10.002
[4] Bille P(2005)《树木编辑距离及相关问题的调查》。计算机科学理论337(1-3):217-239·Zbl 1078.68152号 ·doi:10.1016/j.tcs.2004.12.030
[5] Blin G,Sikora F,Vialette S(2010)使用反馈顶点集查询蛋白质-蛋白质相互作用网络中的图。IEEE/ACM Trans-Comput生物信息7(4):628-635·doi:10.1109/TCBB.2010.53
[6] Bunke H,Riesen K(2009)《图形编辑距离最优和次优算法及其应用》。威利-VCH Verlag GmbH and Co.KGaA,Weinheim·Zbl 1254.68094号
[7] Conte D,Foggia P,Sansone C,Vento M(2004)《模式识别中的图形匹配三十年》。IJPRAI 18(3):265-298
[8] Demaine E,Mozes S,Rossman B,Weimann O(2007)一种树编辑距离的最优分解算法。行业:自动化、语言和编程。计算机科学课堂讲稿,第4596卷。柏林施普林格,第146-157页·Zbl 1171.68843号
[9] 高X,肖B,陶D,李X(2010)图形编辑距离的调查。模式分析应用程序13(1):113-129·Zbl 1422.68211号 ·doi:10.1007/s10044-008-0141-y
[10] Garey MR,Johnson DS(1979)《计算机与难处理性:NP完备性理论指南》。W.H.弗里曼公司,旧金山·Zbl 0411.68039号
[11] Kirkpatrick DG,Hell P(1978)关于广义匹配问题的完备性。摘自:第十届ACM计算理论年会论文集,STOC’78。ACM,纽约,第240-245页·Zbl 1282.68182号
[12] Natanzon A,Shamir R,Sharan R(2001)一些边缘修改问题的复杂性分类。离散应用数学113(1):109-128·Zbl 0982.68104号 ·doi:10.1016/S0166-218X(00)00391-7
[13] Pawlik M,Augsten N(2011)RTED:树编辑距离的稳健算法。PVLDB 5(4):334-345
[14] Sharan R(2002)图形修改问题及其在基因组研究中的应用。Tel-Avi大学博士论文
[15] Zhang K,Jiang T(1994)关于无序标记树的一些MAX SNP-hard结果。Inf过程Lett 49(5):249-254·Zbl 0795.68073号 ·doi:10.1016/0020-0190(94)90062-0
[16] Zhang K,Statman R,Shasha D(1992)关于无序标记树之间的编辑距离。Inf过程Lett 42(3):133-139·Zbl 0780.68070号 ·doi:10.1016/0020-0190(92)90136-J
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。