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罗恩·品特。;哈达斯·沙奇奈;梅拉夫·泽哈维

部分信息网络查询。 （英语） Zbl 1322.68258号

J.离散算法 31, 129-145 (2015).
总结：我们研究部分信息网络查询（PINQ）问题，概括了生物信息学中经常出现的两个问题：线形网络查询（ANQ）问题和无拓扑网络查询（TFNQ）问题。在ANQ和TFNQ中，我们都有一个模式（mathcal{P}）和一个图（H\），并且我们寻找一个相似\（\mathcal{P}\）。ANQ要求知道\（\mathcal{P}\）的拓扑，而TFNQ忽略了它。PINQ适合在\（\mathcal{P}\）拓扑上提供部分信息的情况。我们的主要结果是一个处理PINQ输入的参数化算法，其中\（mathcal{P}\）是一组树。该算法显著提高了求解TFNQ时的最佳运行时间。在解决ANQ的两个特殊情况时，我们还改进了已知的最佳运行时间。

引用于1文件

MSC公司：

68瓦20 随机算法
05C85号 图形算法（图形理论方面）
05C90年 图论的应用
92立方厘米 系统生物学、网络

关键词：

参数化算法;模式匹配;部分信息网络查询;路线网络查询;无拓扑网络查询

软件：

QPath（QPath）;QNet公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{R.Y.Pinter}等人，J.离散算法31，129--145（2015；Zbl 1322.68258）
全文： 内政部

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