×
马赛尔·乔利;何塞·平托。

通过综合数学建模对HIV-1/AIDS动态进行深入分析。 （英语） Zbl 1255.92015年

数学。计算。建模 55，编号3-4，342-366（2012）.
摘要：我们提出了一个新的动态模型的主要结果，该模型旨在确定地表示HIV-1与人类免疫系统之间的复杂关系。该模型的新结构通过在更深入的细胞和分子免疫学现象学下代表不同的宿主解剖分区扩展了先前的工作。最近确定的与HIV-1感染相关的机制以及HIV-1发病机制和免疫学数学模型中通常忽略的其他众所周知的相关机制，如细胞间传播，也将予以阐述。

引用于三文件

理学硕士：

92C60型 医学流行病学

关键词：

HIV-1/AIDS感染;数学模型;计算模拟

软件：

Matlab公司;代码45;代码23;奥德15;代码23;代码113;MATLAB ODE套件
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Joly}和\textit{J.M.Pinto}，数学。计算。55号模型，编号3--4，342--366（2012；Zbl 1255.92015）
全文： 内政部

参考文献：

[1] Ho，D.D。；Neumann，A.U。；Perelson，A.S。；Chen，W。；Leonard，J.M。；Markowitz，M.，HIV-1感染中血浆病毒和CD4淋巴细胞的快速转换，《自然》，373123-126（1995）
[2] 魏，X。；Ghosh，S.K。；M.E.泰勒。；约翰逊，V.A。；埃米尼，E.A。；德国P。；Lifson，J.D。；Bonhoeffer，S。；Nowak，医学硕士。；哈恩，B.H。；萨格，M.S。；Shaw，G.M.，人类免疫缺陷病毒1型感染的病毒动力学，《自然》，373117-122（1995）
[3] 莫里，J.M。；考夫曼，G。；Kelleher，A.D。；Cooper，D.A.，原发性HIV-1感染模型，数学。生物科学。，154, 57-85 (1998) ·Zbl 0938.92020号
[4] 卡米纳，A。；马库奇，R.W。；Zhao，H.，早期HIV-1种群动态的随机建模，数学。生物科学。，170, 187-198 (2001) ·Zbl 1005.92019年
[5] Stengel，R.F.，人类免疫缺陷病毒的突变和控制，数学。生物科学。，213, 93-102 (2008) ·Zbl 1139.92310号
[6] 维克·D。；Self，S.G.，《体内早期HIV感染：研究免疫反应和药物治疗时机的分支过程模型》，数学。生物科学。，165, 115-134 (2000) ·Zbl 0963.92022号
[7] 陈，G。；Shankar等人。；兰格，C。；瓦尔迪兹，H。；斯科尔尼克，P.R。；Wu，L。；Manjunath，N。；Lieberman，J.，人类免疫缺陷病毒、EB病毒和巨细胞病毒特异性CD8 T细胞缺乏归巢到感染淋巴部位的分子，《血液》，98，156-164（2001）
[8] Perelson，A.S。；Nelson，P.W.，HIV-1体内动力学的数学分析，SIAM Rev.，41，3-44（1999）·Zbl 1078.92502号
[9] 弗林特，S.J。；Enquist，L.W。；Krug，R.M。；拉卡尼埃洛，V.R。；Skalka，A.M.，《病毒学原理-分子生物学、发病机制和控制》（2000），ASM出版社：ASM出版社，华盛顿特区
[10] 开普勒，T.B。；Perelson，A.S.，药物浓度异质性促进耐药性的演变，Proc。国家。阿卡德。科学。美国，9511514-11519（1998）·Zbl 0919.92023号
[11] Pantaleo，G。；Graziosi，C。；德马雷斯特，J.F。；布蒂尼，L。；蒙特罗尼，M。；Fox，C.H。；奥伦斯坦，J.M。；科特勒，D.P。；Fauci，A.S.，在疾病的临床潜伏期，HIV感染在淋巴组织中是活跃和进行性的，《自然》，362，355-358（1993）
[12] M.Joly，《动态反应系统的数学建模、优化操作和调度》，圣保罗大学化学工程系博士论文，巴西圣保罗，2004年（葡萄牙文）。；M.Joly，《动态反应系统的数学建模、优化操作和调度》，圣保罗大学化学工程系博士论文，巴西圣保罗，2004年（葡萄牙语）。
[13] Tan，W.Y。；Wu，H.，HIV对CD_（4^+）T细胞动力学的随机建模和一些蒙特卡罗研究，数学。生物科学。，147, 173-205 (1998) ·Zbl 0887.92021号
[14] Lin，H。；Shuai，J.W.，病毒与免疫系统之间非对称战斗的HIV动力学随机空间模型，新J.Phys。，12, 1-18 (2010)
[15] Joly，M。；Pinto，J.M.，《数学模型在优化控制HIV-1发病机制中的作用》，AIChE J.，52，1-28（2006）
[16] 阿巴斯，A.K。；Lichtman，A.H。；Pober，J.S.，《细胞和分子免疫学》（2000），W.B.Saunders公司：W.B.Sounders公司，宾夕法尼亚州费城
[17] Joly，M。；Pinto，J.M.，CXCR4和CCR5在T-和单核巨噬细胞谱系上的调节和表达模式：对HIV-1感染易感性的影响，数学。生物科学。，195, 92-126 (2005) ·Zbl 1065.92027号
[18] 塔克韦尔，H.C。；Le Corfec，E.，早期HIV-1种群动态的随机模型，J.Theoret。《生物学》，195，451-463（1998）
[19] 埃松格，P。；Perelson，A.S.，《CD（4^+）T细胞亚群HIV感染建模》，J.Theoret。《生物学》，170367-391（1994）
[20] Stilianakis，N.I。；Dietz，K。；Schenzle，D.，艾滋病发病机制模型分析，数学。生物科学。，145, 27-46 (1997) ·Zbl 0896.92016号
[21] Shankarappa，R。；Margolick，J.B。；恒河，S.J。；罗德里戈，A.G。；Upchurch，D。；Farzadegan，H。；古普塔，P。；里纳尔多，C.R。；学习，G.H。；何，X。；黄，X。；Mullins，J.M.，与人类免疫缺陷病毒1型感染进展相关的持续病毒进化变化，J.Virol。，73, 10489-10502 (1999)
[22] 洛杉矶蒙特罗。；Gonçalves，C.H.O。；Piqueira，J.R.C.，原发性HIV感染后变异株成功逃逸的条件，J.Theoret。生物，203，399-406（2000）
[23] Hladik，F。；Lentz，G。；阿克里奇，R.E。；彼得森，G。；凯利，H。；麦克罗伊，A。；McElrath，M.J.，《树突状细胞T细胞相互作用支持协同受体依赖性人类免疫缺陷病毒1型在人类生殖道的传播》，J.Virol。，73, 5833-5842 (1999)
[24] Shampine，L.F。；Reichelt，M.W.，《matlab ODE套件》，SIAM J.Sci。计算。，18, 1-22 (1997) ·Zbl 0868.65040号
[25] Ho，D.D.，HIV感染中的病毒计数，《科学》，2721124-125（1996）
[26] 斯塔福德，医学硕士。；Corey，L。；曹毅。；Daar，E.S。；Ho，D.D。；Perelson，A.S.，《原发性HIV感染期间血浆病毒浓度建模》，理论杂志。生物学，203285-301（2000）
[27] 库普，R.A。；Safrit，J.T。；曹毅。；安德鲁斯，C.A。；McLeod，G。；博尔科夫斯基，W。；Farthing，C。；Ho，D.D.，原发性人类免疫缺陷病毒1型综合征中细胞免疫反应与病毒血症初始控制的时间相关性，J.Virol。，68, 4650-4655 (1994)
[28] 曼德雷利，F。；佐藤，H。；Berthold，E。；奥伦斯坦，J。；Martin，M.A.，通过人类免疫缺陷病毒1型的细胞间传播快速诱导细胞凋亡，J.Virol，69，6457-6465（1995）
[29] Pantaleo，G。；Soudeyns，H。；德马雷斯特，J.F。；瓦卡雷扎，M。；Graziosi，C。；Paolucci，S。；Daucher，M。；科恩，O.J。；丹尼斯，F。；比迪森，W.E。；Sekaly，R.P。；Fauci，A.S.，《在原发性HIV感染期间最初扩增的HIV-特异性CD\（8^+）T细胞克隆快速消失的证据》，Proc。国家。阿卡德。科学。美国，949848-9853（1997）
[30] 卡拉姆斯，S.A。；Walker，B.D.，《CD4有助于维持有效细胞毒性T淋巴细胞反应的关键需求》，《实验医学杂志》，1882199-2204（1998）
[31] 卡尔·J·M。；霍金，H。；李，P。；Burrell，C.J.，人类免疫缺陷病毒感染从单核细胞衍生的巨噬细胞到外周血淋巴细胞的快速有效细胞间传播，病毒学，265319-329（1999）
[32] Ludewig，B。；Gelderblom，H.R。；贝克尔，Y。；Schäfer，A。；Pauli，G.，HIV-1从生产性感染的成熟朗格汉斯细胞向原代CD（4^+）T淋巴细胞的传播导致T细胞反应发生改变，IFN-（γ）和IL-10的生成增强，病毒学，215，51-60（1996）
[33] 佐藤，H。；奥伦斯坦，J。；迪米特洛夫，D。；Martin，M.，HIV-1细胞间传播在几分钟内发生，可能不涉及病毒颗粒的参与，病毒学，186712-724（1992）
[34] 南卡罗来纳州斯特兰福德。；Ong，J.C.（安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省）。；Martinez-Mariño，B。；布希，M。；Hecht，F.M。；Kahn，J。；Levy，J.A.，《在初次感染期间接受高效抗逆转录病毒治疗的个体中CD细胞非细胞毒性抗HIV活性的降低》，Proc。国家。阿卡德。科学。美国，98，597-602（2001）
[35] 格罗斯曼，Z。；医学学士范伯格。；Paul，W.E.，《HIV感染中细胞激活和病毒传播的多种模式：慢性和潜在感染细胞在维持病毒复制中的作用》，免疫学，956314-6319（1998）
[36] 布卢尔，C.C。；Wu，L。；霍克西，J.A。；施普林格，T.A。；Mackay，C.R.，HIV共受体CXCR4和CCR5在人类T淋巴细胞上的差异表达和调节，Proc。国家。阿卡德。科学。美国，941925-1930（1997）
[37] 艾伯特，L.M。；McColl，S.R.，异基因激活过程中CXC趋化因子受体和T淋巴细胞CD4表达的协同调节，免疫学杂志。，166, 4870-4878 (2001)
[38] 康纳，R.I。；Sheridan，K.E。；塞拉迪尼，D。；Choe，S。；Landau，N.R.，协受体使用的变化与HIV-1感染者的疾病进展相关，《实验医学杂志》，185，621-628（1997）
[39] Van’t Wout，A.B。；Ran，L.J。；Kuiken，C.L。；新泽西州科斯特拉。；Pals，S.T。；Schuitemaker，H.，《序列血液样本中人类免疫缺陷病毒1型准种与尸检获得的各种器官之间的时间关系分析》，J.Virol。，72, 488-496 (1998)
[40] Wong，J.K。；赫扎雷，M。；Günthard，H.F.，H.根塔尔。；哈夫利尔，D.V。；伊格纳西奥，C.C。；斯皮纳，C.A。；Richman，D.D.，《尽管血浆病毒血症被长期抑制，但复制能力强的HIV的恢复》，《科学》，2781291-1295（1997）
[41] 柯尼格，S。；Gendelman，H.E。；奥伦斯坦，J.M。；Dal Canto，医学博士。；Pezeshkpour，G.H。；Yungbluth，M。；詹诺塔，F。；Aksamit，A。；马丁，硕士。；Fauci，A.S.，《检测患有脑病的艾滋病患者脑组织巨噬细胞中的艾滋病病毒》，《科学》，2331089-1093（1986）
[42] Stilianakis，N.I。；Boucher，C.A.B。；医学博士Jong。；列文，R.V。；舒尔曼，R。；Boer，R.J.，由数学模型解释的人类免疫缺陷病毒1型逆转录酶相关突变体的临床数据集，J.Virol。，71, 1, 161-168 (1997)
[43] 芬奇，D。；赫尔曼科娃，M。；Pierson，T。；Carruth，L.M。；巴克，C。；Chaisson，R.E。；奎因，T.C。；查德威克，K。；Margolick，J。；布鲁克梅耶，R。；Gallant，J。；马科维茨，M。；Ho，D.D。；里奇曼，D.D。；Siliciano，R.，《在接受高效抗逆转录病毒治疗的患者中识别HIV-1的储存库》，《科学》，2781295-1300（1997）
[44] 蔡伟平。；康利，S.R。；Kung，H.F。；Garrity，R.R。；Nara，P.L.，《血液来源巨噬细胞和外周血单个核细胞自体原代细胞检测中HIV-1体外生长周期和传播的初步研究》，病毒学，226205-216（1996）
[45] 巴德利，A.D。；Pilon，A.A。；A.兰迪。；Lynch，D.H.，HIV相关淋巴细胞凋亡的机制，血液，96，9，2951-2964（2000）
[46] 卡尔肖，R。；阮，S.，CD（4^+）T细胞感染HIV的延迟微分方程模型，数学。生物科学。，165, 27-39 (2000) ·Zbl 0981.92009号
[47] Yang，L.P。；莱利，J.L。；卡罗尔·R·G。；6月，C.H。；霍谢，J。；帕特森，B.K。；Y.大岛。；Hodes，R.J。；Delespesse，G.，HIV-1对新生儿CD（8^+）T淋巴细胞的生产性感染，《实验医学杂志》，187，7，1139-1144（1998）
[48] 斯普格，J.L。；R.I.Shrager。；Dimitrov，D.S.，组织培养中HIV-1感染动力学，数学。生物科学。，138, 1-22 (1996) ·Zbl 0873.92023号
[49] Yang，O.O。；卡拉姆斯，S.A。；特罗查，A。；曹，H。；Luster，A。；约翰逊·R·P。；Walker，B.D.，《通过CD\（8^+）细胞抑制人类免疫缺陷病毒1型复制：HLAⅠ类限制性触发细胞炎和非细胞炎机制的证据》，J.Virol。，71, 4, 3120-3128 (1997)
[50] Lee，B。；沙伦，M。；蒙塔纳，L.J。；韦斯曼，D。；Doms，R.W.，《淋巴细胞亚群、树突状细胞和条件不同的单核细胞衍生巨噬细胞上CD4、CCR5和CXCR4水平的量化》，Proc。国家。阿卡德。科学。美国，96，5215-5220（1999）
[51] 艾哈迈德扎德，M。；侯赛因，S.F。；Farber，D.L.，记忆CD4 T细胞反应的异质性：持久效应器和静息记忆T细胞，免疫学杂志。，166, 926-935 (2001)
[52] Nowak，医学硕士。；Bonhoeffer，S。；Shaw，G.M。；May，R.M.，《抗病毒药物治疗：游离病毒和受感染细胞群的耐药性动态》，J.Theoret。生物科学。，184, 203-217 (1997)
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。它的项目与zbMATH标识符启发式匹配，并且可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。