亚历山大·安多尼;君士坦丁·达斯卡拉基斯;阿维纳坦·哈西迪姆;塞巴斯蒂安·罗奇 通过祖先状态重建对分子序列进行全局比对。 （英语） Zbl 1250.92034号 随机过程应用。 122，第12号，3852-3874（2012）. 小结：我们考虑树上的跟踪重建问题（TRPT）：二进制序列通过树信道广播，在树信道中我们允许替换、删除和插入；我们试图从叶子上接收到的序列重建原始序列。TRPT的动机是计算生物学中的多序列比对问题。我们给出了一个简单的递归过程，在低突变率下提供了强大的重建保证。据我们所知，这是在存在indels的情况下，对树进行的第一个严格的轨迹重建结果。 引用于1审查引用于10文件 理学硕士： 92D15型 与进化有关的问题 92立方厘米 系统生物学、网络 60J85型 分支过程的应用 92-08 生物问题的计算方法 关键词：树上的马尔可夫模型;分支过程;系统发育推断 软件：肌肉;集群;MAFFT公司;Bali-phy公司;T-咖啡 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{A.Andoni}等人，《随机过程应用》。122，第12号，3852--3874（2012；Zbl 1250.92034） 全文： 内政部 arXiv公司 链接 参考文献： [1] A.Andoni，M.Braverman，A.Hassidim，《插入和删除的系统发育重建》，预印本，2010年。；A.Andoni，M.Braverman，A.Hassidim，《插入和删除的系统发育重建》，预印本，2010年。 [2] A.Andoni，C.Daskalakis，A.Hassidim，S.Roch，通过祖先状态重建实现分子序列的全球比对，收录于：ICS，2010年。；A.Andoni，C.Daskalakis，A.Hassidim，S.Roch，通过祖先状态重建实现分子序列的全球比对，收录于：ICS，2010年·Zbl 1250.92034号 [3] 安多尼，A。；Krauthgamer，R.，《编辑距离的平滑复杂性》，《计算机课堂讲稿》。科学。，5125, 357-369 (2008) ·Zbl 1153.68563号 [4] 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