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西蒙·林茨;查尔斯·森普尔

贴上叶子和采摘樱桃以表征一组系统发育的杂交数。 （英语） Zbl 1407.05224号

高级申请。数学。 105, 102-129 (2019).
摘要：在过去的十年中，我们看到了在描述和计算根系统发育树集合（mathcal{P}）的最小杂交数方面取得了很大进展。粗略地说，这个最小值量化了解释一组系统发育树所需的杂交事件数量，方法是将它们同时嵌入到系统发育网络中，协议森林的概念是几乎所有与计算when（mathcal{P}|=2）的最小杂交数相关的结果的基础概念。然而，尽管进行了各种尝试，但仍然无法从（|\mathcal{P}|>2）的协议森林来描述这个数字。在本文中，我们刻画了当（mathcal{P}）是任意大小且不一定由二叉树组成时的最小杂交数。在我们之前对樱桃采摘序列的研究基础上，我们首先建立了一个新的特征来计算树-儿童网络空间中的最小杂交数。随后，我们展示了这种特征如何扩展到所有有根的系统发育网络的空间。此外，我们建立了一个特殊的硬度结果，为协议森林的一些局限性提供了新的见解。

引用于1审查
引用于8文件

MSC公司：

05C85号 图形算法（图形理论方面）
92D15型 与进化有关的问题
65年第68季度 算法和问题复杂性分析

关键词：

协议林;樱桃采摘序列;最小杂交;系统发育网络;网状结构;树-儿童网络
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{S.Linz}和\textit{C.Semple}，高级应用程序。数学。105、102-129（2019年；Zbl 1407.05224）
全文： 内政部 arXiv公司

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