×

利用有效的伴随计算,通过测地线拍摄进行差分三维图像配准。 (英语) Zbl 1235.68295号

摘要:在微分同胚引起的大变形的背景下,我们提出了一种新的3D图像微分同胚配准算法,该算法直接在测地线流集上执行优化。这项工作的关键贡献是提供所谓初始动量的精确估计,初始动量是一个标量函数,通过测地线的哈密顿方程编码两幅图像之间的最佳变形。由于初始动量已被证明是形状空间统计的关键工具,因此我们的算法能够对3D图像进行更可靠的统计比较。我们提出的算法是对初始动量的梯度下降,其中梯度是使用最优控制理论中的标准方法计算的。为了提高梯度计算的数值效率,我们开发了与测地线方程相关联的伴随方程的积分公式。然后,我们成功地将其应用于二维模型图像和三维大脑图像的配准。通过将我们的算法与M.F.乞丐等人[“通过微分同构的测地流计算大变形度量映射”,同上61,第2号,139-157(2005)],我们表明它为最优路径提供了更可靠的初始动量估计。除了有希望的统计应用外,我们最后讨论了这项工作开辟的不同视角,特别是在生物医学图像纵向分析的新领域。

MSC公司:

68T45型 机器视觉和场景理解
68单位05 计算机图形;计算几何(数字和算法方面)
92 C55 生物医学成像和信号处理

软件:

LDDMM公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] Allassonnière,S.、Trouvé,A.和;Younes,L.(2005)。通过纹理网格进行测地拍摄和微分匹配。在LNCS中:第3757卷。程序。EMMCVPR。柏林:斯普林格。
[2] Allassonnière,S.、Kuhn,E.、Trouvé,A.和;Amit,Y.(2006)。非刚性变形模型的生成模型和一致性估计算法。ICASSP 2006年会议记录(第14-19页)。
[3] Allassonnière,S.、Amit,Y.和;Trouvé,A.(2007)。面向稠密可变形模板估计的相干统计框架。英国皇家统计学会杂志。B系列,69(1),3–29。
[4] Ashburner,J.(2007)。一种快速差分图像配准算法。神经影像,38,95–113·doi:10.1016/j.欧洲图像.2007.07.007
[5] Avants,B.B.、Epstein,C.L.、Grossman,M.、Gee,J.C.(2008)。具有互相关的对称微分图像配准:评估老年人和神经退行性脑的自动标记。医学图像分析,12,26–41·doi:10.1016/j.media.2007.06.004
[6] Beg,M.F.,Helm,P.A.,McVeigh,E.,Miller,M.I.和;Winslow,R.L.(2004)。使用MRI的计算心脏解剖。《医学中的磁共振》,52(5),1167-1174·doi:10.1002/mrm.20255
[7] Beg,M.F.,Miller,M.I.,Trouvé,A.和;Younes,L.(2005)。通过微分同态测地流计算大变形度量映射。国际计算机视觉杂志,61139-157·Zbl 1477.68459号 ·doi:10.1023/B:VISI.0000043755.93987.aa
[8] 科克伯恩,B.,&;Shu,C.W.(2001)。对流占优问题的Runge-Kutta间断Galerkin方法。科学计算杂志,16(3),173·Zbl 1065.76135号 ·doi:10.1023/A:1012873910884
[9] Davis,B.C.,Fletcher,P.T.,Bullitt,E.和;Joshi,S.(2010年)。随机设计数据的总体形状回归。国际计算机视觉杂志,90(2),255-266·doi:10.1007/s11263-010-0367-1
[10] Du,J.、Younes,L.和;邱(2011)。通过整合脑沟和脑回曲线、皮层表面和图像,绘制全脑差异性度量图。《神经影像》,56(1),162-173·doi:10.1016/j.neuroimage.2011.01.067
[11] Dupuis,P.、Grenander,U.和;Miller,M.(1998)。图像匹配中微分流的变分问题。应用数学季刊·Zbl 0949.49002号
[12] Durrleman,S.、Pennec,X.、Trouvé,A.、Gerig,G.和;Ayache,N.(2009年)。纵向数据集中发育延迟检测的时空图谱估计。MICCAI(第5761卷,第297-304页)。
[13] Fletcher,P.T.(2004)。非线性空间中的统计可变性:应用于形状分析和dt-mri。北卡罗来纳大学计算机科学系博士论文。
[14] Fletcher,P.T.、Lu,C.、Pizer,M.和;Joshi,S.(2004)。用于形状非线性统计研究的主测地线分析。IEEE Transactions Medical Imaging,995–1005。
[15] Fletcher,P.T.、Venkatasubramanian,S.和;Joshi,S.(2008)。基于几何中值的黎曼流形稳健统计。计算机视觉和模式识别(第1-8页)。
[16] Gratton,S.、Lawless,A.和;Nichols,N.(2007年)。非线性最小二乘问题的近似高斯-纽顿方法。SIAM优化杂志,18(1),106–132·Zbl 1138.65046号 ·doi:10.1137/050624935
[17] Grenander,U.(1993年)。一般模式理论。牛津:牛津科学出版社·Zbl 0827.68098号
[18] 英国格伦纳德;Miller,M.I.(1998)。计算解剖学:一门新兴学科。应用数学季刊,LVI(4),617-694·Zbl 0952.92016号
[19] Grenander,U.、Srivastava,A.和;Saini,S.(2006年)。使用迭代微分同态描述生物生长。ISBI(第1136-1139页)。
[20] Grenander,U.、Srivastava,A.和;Saini,S.(2007)。生物生长的模式理论表征。IEEE医学成像学报,26(5),648–659·doi:10.1109/TMI.2006.891500
[21] Hart,G.L.、Zach,C.和;Niethammer,M.(2009年)。变形配准的最优控制方法。计算机视觉和模式识别研讨会(第9-16页)。
[22] Helm,P.A.、Younes,L.、Beg,M.F.、Ennis,D.B.、Leclercq,C.、Faris,O.P.、McVeigh,E.、Kass,D.、Miller,M.I.和;Winslow,R.L.(2006年)。失同步性心力衰竭患者结构重塑的证据。循环研究,98,125–132·doi:10.1161/01.RES.0000199396.30688.eb
[23] Holm,D.D.,Trouvé,A.和;Younes,L.(2009年出版)。欧拉-庞加莱变态理论。应用数学季刊·Zbl 1186.68413号
[24] Jiang,G.S.和;Shu,C.W.(1996)。有效实施加权ENO方案。计算物理杂志,126·Zbl 0877.65065号
[25] Joshi,S.和;Miller,M.(2000年)。通过大变形微分同胚进行地标匹配。IEEE图像处理汇刊,9(8),1357–1370·Zbl 0965.37065号 ·数字对象标识代码:10.1109/83.855431
[26] A.Khan和;Beg,M.(2008)。大变形差异框架中时变形状的表示。ISBI(第1521-1524页)。
[27] Klein,A.、Andersson,J.、Ardekani,B.A.、Ashburner,J.,Avants,B.、Chiang,M.C.、Christensen,G.E.、Collins,D.L.、Gee,J、Hellier,P.、Song,J.H.、Jenkinson,M.、Lepage,C.、Rueckert,D.、Thompson,P.,Vercauteren,T.、Woods,R.、Mann,J.和amp;Parseya,R.V.(2009)。14种非线性变形算法在人脑MRI配准中的应用评价。《神经影像》,46(3),786–802·doi:10.1016/j.欧洲图像.2008.12.037
[28] Le Dimet、F.X.和;Talagrand,O.(1986)。气象观测分析和同化的变分算法:理论方面。Tellus系列A,38,97–110。
[29] Le Dimet,F.X.,Ngodock,H.E.和;Navon,I.M.(1997)。变分资料同化中的敏感性分析。日本气象学会杂志,145-155。
[30] Le Veque,R.J.(2002)。双曲线问题的有限体积法。剑桥:剑桥大学出版社。
[31] Lee,J.M.(1997)。黎曼流形曲率导论。数学研究生论文柏林:施普林格。
[32] Ma,J.Miller,M.I.Younes,L.(2010年)。表面模板估计的贝叶斯生成模型。国际生物医学成像杂志,2010,14·doi:10.1155/2010/974957
[33] 马斯兰,S.,&;McLachlan,R.I.(2007)。用于微分图像配准的哈密顿粒子方法。计算机科学讲义:第4548卷。医学图像信息处理学报(第396–407页)。柏林:斯普林格。
[34] Miller,M.和;Younes,L.(2001)。《群体行动、同胚和匹配:一般框架》,《国际计算机视觉杂志》,第41期,第61-84页·Zbl 1012.68714号 ·doi:10.1023/A:101116132514
[35] Miller,M.I.、Trouve,A.和;Younes,L.(2002)。关于计算解剖学的度量和欧拉-拉格朗日方程。生物医学工程年鉴,4375–405·doi:10.1146/annurev.bioeng.4.092101.125733
[36] M.I.Miller、A.Trouvé和;Younes,L.(2006)。计算解剖学的测地摄影。数学成像与视觉杂志,24(2),209-228·Zbl 1478.92084号 ·doi:10.1007/s10851-005-3624-0
[37] Murgasova,M.、Aljabar,P.、Srinivasan,L.、Counsell,S.J.、Doria,V.、Serag,A.、Gousias,I.S.、Boardman,J.P.、Rutherford,M.A.、Edwards,A.D.、Hajnal,J.V.和;Rueckert,D.(2011年)。发育中大脑的动态4d概率图谱。《神经影像》,54(4),2750-63·doi:10.1016/j.neuroimage.2010.10.019
[38] Ngodock,H.E.(2005年)。用表示法有效实现数据同化的协方差乘法。海洋建模,8(3),237-251·doi:10.1016/j.ocemod.2003.12.005
[39] Niethammer,M.、Hart,G.和;Zach,C.(2009)。图像时间序列配准的最优控制方法。2427–2434.
[40] Pennec,X.(2009)。流形上的统计计算:从黎曼几何到计算解剖学。视觉计算的新兴趋势,5416,347–386·doi:10.1007/978-3-642-00826-9_16
[41] Risser,L.、Vialard,F.X.、Wolz,R.、Holm,D.D.和;Rueckert,D.(2010年)。同时进行精细和粗糙差异形态配准:在阿尔茨海默病萎缩测量中的应用。在医学图像计算和计算机辅助干预(MICCAI)国际会议上。计算机科学课堂讲稿。
[42] Risser,L.、Vialard,F.、Wolz,R.、Murgasova,M.、Holm,D.和;Rueckert,D.(2011年)。使用大变形差分度量映射的同时多尺度配准IEEE医学成像学报,99,1。doi:10.1007/s11263-011-0481-8
[43] Sasaki,Y.(1970年)。数值变分中的一些基本形式。《月度天气回顾》,98,875–883·doi:10.1175/1520-0493(1970)098<0875:SBFINV>2.3.CO;2
[44] Shu,C.W.(2009)。对流占优问题的高阶加权本质非振荡格式。SIAM评论,51(1),82·Zbl 1160.65330号 ·doi:10.1137/070679065
[45] Singh,N.、Fletcher,P.T.、Preston,J.S.、Ha,L.、King,R.、Marron,J.S、Wiener,M.和;Joshi,S.(2010年)。解剖形态与神经心理测量相关的变形动量的多元统计分析。在T.Jiang,N.Navab,J.P.Pluim,&amp;Viergever M.A.(编辑),MICCAI(第529-537页)。柏林:斯普林格。
[46] Sled,J.G.、Zijdenbos,A.P.和;Evans,A.C.(1998年)。一种自动校正MRI数据中强度不均匀性的非参数方法。IEEE医学成像汇刊,17(1),87–97·数字对象标识代码:10.1109/42.668698
[47] Trouvé,A.(1998年)。图像分析中的差分群和模式匹配。国际计算机视觉杂志,28(3),213-221·doi:10.1023/A:1008001603737
[48] 特鲁维,A.,&;Vialard,F.X.(2010年,接受出版)。形状样条曲线和随机形状演化:二阶观点。应用数学季刊。
[49] 特鲁维,A.,&;Younes,L.(2005)。可变形模板的局部几何体。SIAM数学分析杂志·1090.58008兹罗提
[50] Vaillant,M.,Miller,M.I.,Trouvé,A.,Younes,L.(2004)。基于切空间表示的微分同态统计。神经影像,23(S1),S161–S169·doi:10.1016/j.neuroimage.2004.07.023
[51] Vercauteren,T.、Pennec,X.、Perchant,A.和;Ayache,N.(2009年)。差分恶魔:高效的非参数图像配准。《神经影像》,45(1),S61–S72·doi:10.1016/j.欧洲图像.2008.10.040
[52] Vialard,F.X.(2009)。微分框架中形状空间的哈密顿方法:从不连续图像匹配问题到随机增长模型。博士论文,Ecole Normale Supérieure de Cachan。
[53] 维亚拉德,F.X.,&;Santambrogio,F.(2009年)。推广到大变形微分匹配方法的BV函数。Comptes Rendus Mathematique,347(1-2),27-32·Zbl 1154.49011号 ·doi:10.1016/j.crma.2008.11.019
[54] Wang,L.、Beg,M.F.、Ratnanather,J.T.、Ceritoglu,C.、Younes,L.、Morris,J.、Csernansky,J.和;Miller,M.I.(2006)。阿尔茨海默型痴呆大变形差异化和基于动量的海马形状辨别。IEEE医学成像学报,26,462–470·doi:10.1109/TMI.2006.887380
[55] Younes,L.(2007)。微分同态群中的Jacobi域及其应用。应用数学季刊,65113-134·Zbl 1128.53040号
[56] Younes,L.(2010)。形状和差异。柏林:斯普林格·Zbl 1205.68355号
[57] Younes,L.、Arrate,F.和;Miller,M.I.(2009年)。计算解剖学中的进化方程。《神经影像》,45(1),S40-S50。脑成像数学(补充1)·doi:10.1016/j.neuroimage.2008.10.050
[58] Zeidler,E.(1995)。应用功能分析:主要原理及其应用。应用数学科学,109·Zbl 0834.46003号
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。