×
Jean-Baptiste Schiratti;阿莱索尼埃，圣芬尼;奥利维尔·科利奥特;斯坦利·德勒曼

贝叶斯混合效应模型，用于从重复的流形值观测中学习变化轨迹。 （英语） Zbl 1442.62116号

J.马赫。学习。物件。 18（2017-2018），论文编号133，33 p.（2017）.
摘要：我们提出了一个通用的贝叶斯混合效应模型，用于根据在多个时间点对一群个体的观测来估计生物现象的时间进程。通过测量空间中的连续轨迹对进展进行建模。个别进展轨迹是平均轨迹时空变换的结果。这些转换允许量化跟踪轨迹的方向和速度的变化。黎曼几何框架允许该模型用于具有平滑约束的任何类型的测量。使用期望最大化算法的随机版本生成参数的最大后验估计。我们使用一系列来自轻度认知障碍患者、后来诊断为阿尔茨海默病患者的神经心理学测试分数，以及模拟对称正定矩阵的演变来评估我们的方法。数据驱动的模型认知功能受损说明了这些功能在人群中下降的顺序和时间上的可变性。我们表明，估计的时空变换有效地将个体发展过程中的重要事件对应起来。

引用于9文件

MSC公司：

62H11型 定向数据；空间统计学
62兰特 歧管统计
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析

关键词：

纵向模型;时空分析;黎曼几何;随机期望最大化算法

软件：

Monolix公司;固定点算法;坚果
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{J.-B.Schirati}等人，J.Mach。学习。第18号决议，第133号论文，33页（2017年；Zbl 1442.62116）
全文： 链接

参考文献：

[1] Stéphanie Allassonnière、Estelle Kuhn和Alain Trouve。通过随机近似算法构建贝叶斯变形模型：收敛性研究。伯努利，16（3）：641-6782010·Zbl 1220.62101号
[2] V.Arsigny、P.Fillard、X.Pennec和N.Ayache。扩散张量快速简单计算的对数核素度量。医学中的磁共振，56（2）：411-4212006。
[3] Y.F.Atchadé。具有截断漂移的metropolis-adjusted langevin算法的自适应版本。应用概率的方法论和计算，8（2）：235-2542006·兹比尔1104.65004
[4] L.G.Bandini、A.Must、J.L.Spadano和W.H.Dietz。绝经前女孩的身体成分、父母超重、青春期和种族与能量消耗的关系。美国临床营养学杂志，76（5）：1040-10472002。
[5] T.F.Coleman和D.C.Sorensen。关于矩阵零空间正交基计算的注记。数学规划，29（2）：234-2421984·Zbl 0539.65020号
[6] I.Delor、JE、Charoin、R.Gieschke、S.Retout和P.Jackmin。使用疾病发作时间和疾病轨迹概念对阿尔茨海默病的疾病进展进行建模，并将其应用于adni的cdr-sob评分。CPT：药理学与系统药理学，2（10）：e782013。
[7] Arthur P Dempster、Nan M Laird和Donald B Rubin。通过em算法从不完整数据中获得最大似然。皇家统计学会杂志。B系列（方法学），第1-38页，1977年·Zbl 0364.62022号
[8] M.P.Do Carmo Valero先生。黎曼几何。Birkhäuser，1992年。
[9] S.Durrleman、X.Pennec、A.Trouvé、G.Gerig和N.Ayache。纵向数据集中发育延迟检测的时空图谱估计。在医学图像计算和计算机辅助干预国际会议上，第297-304页。施普林格-柏林-海德堡，2009年。
[10] 斯坦利·德勒曼（Stanley Durrleman）、泽维尔·佩内克（Xavier Pennec）、阿兰·特鲁维（Alain Trouvé）、何塞·布拉加（JoséBraga）、吉多·格利格（Guido Gerig）和尼古拉斯·阿亚奇（Nicholas Ayache）。建立纵向形状数据时空统计分析的综合框架。国际计算机视觉杂志，103（1）：22-592013·Zbl 1270.68345号
[11] C.艾森哈特。方差分析所依据的假设。生物统计学，3（1）：1-21947。
[12] G.M.Fitzmaurice、N.M.Laird和J.H.Ware。应用纵向分析，第998卷。John Wiley&Sons，2012年·Zbl 1057.62052号
[13] T.弗莱彻。黎曼流形上的测地回归。《第三届计算解剖学数学基础国际研讨会论文集——建模生物形状变化的几何和统计方法》，第75-86页，2011年。
[14] Hubert M Fonteijn、Marc Modat、Matthew J Clarkson、Josephine Barnes、Manja Lehmann、Nicola Z Hobbs、Rachael I Scahill、Sarah J Tabrizi、Sebastien Ourselin、Nick C Fox等。30疾病进展的事件模型及其在家族性阿尔茨海默病和亨廷顿病中的应用。神经影像，60（3）：1880-18892012。
[15] M.D.Hoffman和A.Gelman。无回转取样器：在哈密顿蒙特卡罗中自适应设置路径长度。《机器学习研究杂志》，15（1）：1593-16232014·Zbl 1319.60150号
[16] Yi Hong、Nikhil Singh、Roland Kwitt和Marc Niethammer。时间分割测地回归。在医学图像计算和计算机辅助干预国际会议上，第105-112页。斯普林格，2014年。
[17] Aapo Hyvärinen、Juha Karhunen和Erkki Oja。独立成分分析，第46卷。John Wiley&Sons，2004年。
[18] B.M.Jedynak、A.Lang、B.Liu、E.Katz、Y.Zhang、B.T.Wyman、D.Raunig、C.P.Jedyna、B.Caffo、J.L.Prince等人。计算性神经退行性疾病进展评分：阿尔茨海默病神经成像倡议队列的方法和结果。神经影像，63（3）：1478-14862012。
[19] I.Koval、J.-B.Schiratti、A.Routier、M.Bacci、O.Colliot、S.Allassonnière和S.Durrleman。纵向流形值网络时空模式的统计学习。医学图像计算和计算机辅助干预，2017年。
[20] E.Kuhn和M.Lavielle。将em的随机近似版本与mcmc程序耦合。ESAIM:概率与统计，8:115-1312004·Zbl 1155.62420号
[21] Nan M Laird和James H Ware。纵向数据的随机效应模型。《生物统计学》，第963-974页，1982年·Zbl 0512.62107号
[22] M.Lavielle和F.Mentré。用monix软件估算艾滋病毒患者中沙奎那韦的人群药代动力学参数。药代动力学和药效学杂志，34（2）：229-2492007。
[23] C.Lenglet、M.Rousson、R.Deriche和O.Faugeras。多元正态分布流形的统计学：扩散张量磁共振成像处理的理论和应用。数学成像与视觉杂志，25（3）：423-4442006·Zbl 1478.62387号
[24] M.Lorenzi、X.Pennec、G.B Frisoni和N.Ayache。在结构磁共振图像中从阿尔茨海默病中分离出正常衰老。衰老的神经生物学，36:S42-S522015。
[25] M.Moakher和M.Zéraï。正定矩阵空间的黎曼几何及其在正定矩阵值数据正则化中的应用。数学成像与视觉杂志，40（2）：171-1872011·Zbl 1255.68195号
[26] R.C.Mohs、D.Knopman、R.C.Petersen、S.H.Ferris、C.Ernesto、M.Grundman、M.Sano、L.Bieliauskas、D.Geldmacher、C.Clark等。开发用于抗痴呆药物临床试验的认知工具：增加阿尔茨海默病评估量表，扩大其范围。阿尔茨海默病和相关疾病，11:13-211997。31
[27] X.Pennec、P.Fillard和N.Ayache。张量计算的黎曼框架。国际计算机视觉杂志，66（1）：41-662006·Zbl 1287.53031号
[28] 彼得森（P.Petersen）。黎曼几何，第171卷。斯普林格，2006年·Zbl 1220.53002号
[29] S.M.Phillips、L.G.Bandini、D.V.Compton、E.N.Naumova和A.Must。青少年女孩全身水分和生物电阻抗对身体成分的纵向比较。《营养学杂志》，133（5）：1419-14252003。
[30] G.O.Roberts，A.Gelman，W.R.Gilks，et al.随机行走大都会算法的弱收敛性和最优缩放。应用概率年鉴，7（1）：110-1201997·兹比尔0876.60015
[31] J.-B.Schiratti、S.Allassonnière、O.Colliot和S.Durrleman。用于纵向流形值数据时空分析的混合效应模型。第五届计算机解剖学数学基础MICCAI研讨会，2015a。
[32] J.-B.Schiratti、S.Allassonnière、O.Colliot和S.Durrleman。从流形值纵向数据中学习时空轨迹。《神经信息处理系统进展》，第2404-2412页，2015b。
[33] J.-B.Schiratti、S.Allassonnière、A.Routier、O.Colliot、S.Durrleman和ADNI。纵向单变量流形值数据的一种带时间重编程的混合效应模型。在医学成像信息处理国际会议上，第564-575页。施普林格，2015年c。
[34] N.Singh、J.Hinkle、S.Joshi和P.T.Fletcher。微分同态层次测地线模型的一种高效并行算法。2014年IEEE第11届国际生物医学成像研讨会（ISBI），第341-344页。IEEE，2014年。
[35] Nikhil Singh、Jacob Hinkle、Sarang Joshi和P Thomas Fletcher。用于不同地貌纵向形状分析的分层测地线模型。医学成像信息处理，第560-571页。施普林格，2013年。
[36] L.T.斯科夫加德。多元正态模型的黎曼几何。《斯堪的纳维亚统计杂志》，第211-223页，1984年·Zbl 0579.62033号
[37] J.Su、S.Kurtek、E.Klassen、A.Srivastava等。黎曼流形上轨迹的统计分析：鸟类迁徙、飓风追踪和视频监控。应用统计年鉴，8（1）：530-5522014·Zbl 1454.62554号
[38] G.韦贝克和G.莫伦伯格。纵向数据的线性混合模型。Springer科学与商业媒体，2009年·Zbl 1162.62070号
[39] Eric Yang、Michael Farnum、Victor Lobanov、Tim Schultz、Nandini Raghavan、Mahesh N Samtani、Gerald Novak、Vaibhav Narayan和Allitia DiBernardo。量化阿尔茨海默病的病理生理时间表。《阿尔茨海默病杂志》，26（4）：745–7532011年。32
[40] A.L.Young、N.P.Oxtoby、J.Huang、R.V.Marinescu、P.Daga、D.M.Cash、N.C.Fox、S.Ourselin、J.M.Schott、D.C.Alexander等人。疾病进展中事件的多重排序。国际医学影像信息处理会议，第711-722页。斯普林格，2015年。
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。