希法·塔里克·阿什拉夫;阿伊莎·奥贝德;穆罕默德·塔里克·赛义德;阿纳姆·纳兹;法蒂玛·沙希德;贾米尔·艾哈迈德;阿姆贾德·阿里 肝细胞癌中TGF-(β1)和MMP-9相互作用及其动力学的正式模型。 (英语) Zbl 1497.92047号 数学。Biosci公司。工程师。 16,第5号,3285-3310(2019). MSC公司: 92立方 病理学、病理生理学 关键词:转化生长因子-(β1);基质金属蛋白酶-9;肝癌;定性建模;Petri网 软件:清爽;NuSMV公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.T.Ashraf}等人,数学。Biosci公司。工程16,编号5,3285--3310(2019;Zbl 1497.92047) 全文: DOI程序 OA许可证 参考文献: [1] GBD 2013死亡率和死因合作者,全球、地区和国家240个死因的年龄-性别特定全因和特定死因死亡率 [2] B.K.Yoo,L.Emdad,Z.Su等,星形胶质细胞升高的基因-1调节肝细胞癌的发展和进展,临床杂志。投资。,119 (2009), 465-477. [3] N.Portolani、A.Coniglio、S.Ghidoni等人,肝细胞切除术后早期和晚期复发 [4] C.E.Brinckerhoff和L.M.Matrisian,TIMELINEMatrix [5] 陈瑞敏,崔建军,徐春春,等,MMP-9与MMP-2在肝癌侵袭性和肝癌根治术后复发中的意义,《肿瘤外科年鉴》。,19 (2012), 375-384. [6] C.Gialeli、A.D.Theocharis和N.K.Karamanos,基质金属蛋白酶在癌症进展中的作用及其药理靶向,FEBS J.,278(2011),16-27。 [7] E.I.Deryugina和J.P.Quigley,基质金属蛋白酶与肿瘤转移,《癌症转移评论》,25(2006),9-34。 [8] R.Derynck,R.J.Akhurst和A.Balmain,TGF-|[β]|肿瘤抑制和癌症进展中的信号转导,自然遗传学。,29 (2001), 117-129. [9] Y.Katsuno,S.Lamouille和R.Derynk,转化生长因子-β信号转导和上皮-间质转化在癌症进展中的作用,Curr。操作。Oncol.公司。,25 (2013), 76-84. [10] A.Safina、M.Q.Ren、E.Vandette等,TAK1是TGF-β1介导的基质金属蛋白酶-9和转移癌基因调控所必需的。,27 (2008), 1198-1207. [11] S.L.Dallas、J.L.Rosser、G.R.Mundy等人,破骨细胞对潜在转化生长因子β(TGF-β)结合蛋白-1的蛋白水解。从骨基质中释放TGF-β的细胞机制,J.Biol。化学。,277 (2002), 21352-21360. [12] J.Li,B.Yang,Q.Zhou,等,自噬通过激活上皮-间充质转化促进肝细胞癌细胞侵袭,《肿瘤发生》,34(2013),1343-1351。 [13] 陈国庆,秦国庆,党勇,等,基质金属蛋白酶-2/9和转化生长因子β1在加速肝细胞癌进展中的前瞻性作用,Transl。癌症研究,6(2017),S229-S231。 [14] A.V.Bakin、A.K.Tomlinson、N.A.Bhowmick等,《转化生长因子β介导的上皮细胞向间充质细胞转化和细胞迁移需要磷脂酰肌醇3-激酶功能》,J.Biol。化学。,275 (2000), 36803-36810. [15] J.H.Zuo,W.Zhu,M.Y.Li,等,EGFR激活通过诱导EMT样表型改变和MMP-9介导的E-cadherin降解促进鳞癌SCC10A细胞迁移和侵袭,J.cell。生物化学。,112 (2011), 2508-2517. [16] J.Krstic和J.F.Santibanez,转化生长因子-β和基质金属蛋白酶在癌症中的功能相互作用;上皮细胞向间充质细胞转化的意义,细胞生物学。Res.Ther.,研究与治疗。,s1(2016)。 [17] R.Bataller和D.A.Brenner,《肝纤维化》,临床杂志。投资。,115 (2005), 209-218. [18] H.de Jong,遗传调控的建模与模拟 [19] L.Glass和S.A.Kauffman,《连续非线性生化控制网络的逻辑分析》。,J.西奥。《生物学》,39(1973),103-29。 [20] H.DEJONG,J.GOUZE,C.HERNANDEZ等,使用分段线性模型对遗传调控网络进行定性模拟,布尔。数学。《生物学》,66(2004),301-340·Zbl 1334.92282号 [21] R.Thomas和R.D'Ari,《生物反馈》,CRC出版社,1990年。https://www.crcpress.com/Biological-Feedback/Thomas-DAri/p/book/9780849367663。 ·Zbl 0743.92003号 [22] E.M.Clarke、O.Grumberg和D.A.Peled,《模型检验》,麻省理工学院出版社,1999年。https://mitpress.mit.edu/books/model-checking。 ·Zbl 1423.68002号 [23] D.B.Z.Khalis、J.P.Comet和A.Richard,发现基因调控网络、基因、基因组和基因组模型的SMBioNet方法。,1 (2009), 15-22. [24] G.Bernot,J.P.Comet,A.Richard等,《形式方法在生物调控中的应用》 [25] A.Cimatti、E.M.Clarke E.Giunchiglia等人,NuSMV [26] A.G.Gonzalez、A.Naldi、L.Sánchez等人。 [27] J.Ahmad,Modélisation hybride et analysis des dynamicques des re seaux de réregulations biologiques en tenant compte des délais,博士论文,南特。,(2009). [28] M.Heiner、M.Herajy、F.Liu等人,《史努比——统一Petri网工具》(2012),第398-407页。 [29] A.Naldi,D.Berenguier,A.Fauré等,《利用GINsim 2.3对监管网络进行逻辑建模》,生物系统,97(2009),134-139。 [30] A.Saadatpour、R.Albert和T.C.Reluga,经证明可保持吸引子的布尔网络模型的简化方法,SIAM J.Appl。动态。系统。,12 (2013), 1997-2011. ·兹比尔1308.92040 [31] E.Plahte,T.Mestl和S.W.Omholt,反馈回路,动力学系统中的稳定性和多稳态,J.Biol。系统。,03 (1995), 409-413. ·Zbl 0833.34027号 [32] D.Bissell、D.Roulot和J.George,《转化生长因子β与肝脏》,《肝病学》,34(2001),859-867。 [33] 陈国庆,秦国庆,党勇,等,基质金属蛋白酶-2/9和转化生长因子β1在加速肝细胞癌进展中的前瞻性作用,Transl。癌症研究,6(2017),S229-S231。 [34] M.Bond、A.J.Chase、A.H.Baker等,抑制转录因子NF-kappaB减少血管平滑肌细胞产生基质金属蛋白酶-1、-3和-9。,心血管疾病。《决议》,50(2001),556-565。 [35] H.Nakatsukasa,人类肝细胞癌中金属蛋白酶组织抑制剂1和2转录物的细胞分布,《肝病学》,24(1996),82-88。 [36] P.Shannon、A.Markiel、O.Ozier等人。 [37] A.Keutgens、I.Robert、P.Viatour等,血液恶性肿瘤中NF-kappaB活性的非调节。,生物化学。药理学。,72 (2006), 1069-80. [38] W.G.Stetler-Stevenson,基质金属蛋白酶 [39] A.Ma’ayan,系统生物学网络分析导论,科学。信号。,4(2011年),tr5。 [40] O.Palmieri、T.Mazza、S.Castellana等人,《炎症性肠病与系统的相遇》 [41] G.Giannelli、E.Villa和M.Lahn,转化生长因子-β作为肝细胞癌的治疗靶点,《癌症研究》,74(2014),1890-1894。 [42] G.Giannelli、A.Mazzocca、E.Fransvea等,抑制肝细胞癌中TGF-β信号传导,生物化学。生物物理学。癌症学报。,1815 (2011), 214-223. [43] J.Wang,C.-P.Zhu,P.-F.Hu,等,FOXA2通过抑制基质金属蛋白酶-9部分抑制肝细胞癌转移,《肿瘤发生》,35(2014),2576-2583。 [44] H.B.Yu,H.F.Zhang,D.Y.Li,et al.,《亚洲天然产物研究杂志》,苦参碱抑制基质金属蛋白酶-9的表达和人类肝癌细胞的侵袭,《亚洲自然生产研究期刊》,13(2011),3-242。 [45] C.F.Huang,Y.H.Teng,F.J.Lu,et al.,β-芒果苷通过抑制MMP-2和MMP-9的表达并激活ERK和JNK通路抑制人肝癌细胞的侵袭,环境。毒理学。,32 (2017), 2360-2370. [46] M.Egeblad和Z.Werb,基质金属蛋白酶在癌症进展中的新功能,《国家癌症评论》。,2 (2002), 161-174. [47] M.D.Sternlicht和Z.Werb,《基质金属蛋白酶如何调节细胞行为》,年。细胞发育生物学评论。,17 (2001), 463-516. [48] 秦刚,罗明明,陈建军,等,MMP-8和TGF-β1相互激活刺激EMT和肝细胞癌恶性进展,癌症快报。,374 (2016), 85-95. [49] H.Kitano,展望未来 [50] D.THIEFFRY和R.THOMAS,生物调控网络的动力学行为-II。λ噬菌体*的免疫控制,公牛。数学。《生物学》,57(1995),277-297·2010年8月19日 [51] V.K.Rakyan,T.A.Down,D.J.Balding等人,《常见人类疾病的表观基因组全关联研究》,国家遗传学杂志。,12 (2011), 529-541. [52] B.BIERIE和H.MOSES,TGF-β与癌症,细胞因子生长因子评论,17(2006),29-40。 [53] A.Noöl,M.Jost和E.Maquoi,癌症-肿瘤-宿主界面的基质金属蛋白酶,Semin。细胞发育生物学。,19 (2008), 52-60. [54] K.Kessenbrock、V.Plaks和Z.Werb,矩阵 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。