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具有种子库的多群体Wright Fisher。 (英文) 兹比尔1368.92120

本文重点介绍Wright-Fisher模型(多殖民版本),最初在[J.布拉斯等人,“具有强大种子库成分的Wright-Fisher模型的谱系”,Prog。普罗巴伯。69, 81–100 (2015;doi:10.1007/978-3-319-13984-54)]在这种情况下,围绕种子库建立的群体作为遗传库,可以通过重采样和突变进行进化。本文首先详细描述了模型及其早期版本(由I.卡吉等人[J.Appl.Probab.38,No.2,285–300(2001;2017年9月9日Zbl)]),然后描述使用种子库的作用和后果。接下来,介绍了多克隆扩展,并研究了迁移和/或突变的影响。作者还讨论了特殊参数选择(和空间二阶矩)的影响。

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92D10型 遗传学和表观遗传学
92D15型 与进化有关的问题
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参考文献:

[1] (Abramowitz,M.;Stegun,I.A.,《数学函数手册》(1972),多佛)·Zbl 0543.33001号
[2] 布拉斯,J。;González Casanova,A。;埃尔登,B。;Kurt,N.,《具有强种子库成分的Wright Fisher模型的谱系》,(第十一届概率与随机过程研讨会,第十一届几率与随机过程会议,《概率的进展》,第69卷(2015),Birkhaüser),81-100·Zbl 1498.60349号
[3] 布拉斯,J。;González Casanova,A。;库尔特,北。;斯潘诺,D.,《长期种子库模型的祖先过程》,J.Appl。概率。,50, 741-759 (2013) ·Zbl 1301.92053号
[4] 布拉斯,J。;González Casanova,A。;库尔特,北。;Wilke-Berenguer,M.,一种用于种子库模型的新聚结剂,Ann.Appl。概率。,26, 857-891 (2016) ·Zbl 1339.60137号
[5] den Hollander,W.Th.F。;Kasteleyn,P.W.,具有周期性分布陷阱的晶格上“自发辐射”的随机游动,《物理学》,112A,523-543(1982)
[6] Durrett,R.(DNA序列进化的概率模型。DNA序列进化的概率模型,概率及其应用(2008),施普林格)·Zbl 1311.92007年
[7] González Casanova,美国。;Aguirre-von Wobeser,E。;埃斯普·恩,G。;Servn-González,L。;库尔特,北。;跨度o,D。;布拉斯,J。;Soberón-Chávez,G.,《细菌进化中的强大种子库效应》,J.Theoret。《生物学》,35662-70(2014)·Zbl 1412.92198号
[8] Hartl,D.L。;Clark,A.G.,《群体遗传学原理》(1997年),西诺协会出版社:西诺协会,出版社马萨诸塞州桑德兰
[9] Hughes,B.D.,《随机行走和随机环境》,第1卷:随机行走(1995),克拉伦登出版社:牛津克拉伦登出版公司·Zbl 0820.60053号
[10] Kaj,I。;Krone,S。;Lascoux,M.,种子库模型的凝聚理论,J.Appl。概率。,38, 285-300 (2001) ·2017年9月9日Zbl
[11] Lennon,J.T。;Jones,S.E.,《微生物种子库:休眠的生态和进化影响》,《自然微生物评论》。,9, 119-130 (2011)
[12] Montroll,E.W.,《格子上的随机漫步》,Proc。交响乐。申请。数学。,16, 193-220 (1964) ·Zbl 0139.34901号
[13] Montroll,E.W.,《格子上的随机漫步III》,J.Math。物理。,10, 753-765 (1969) ·Zbl 1368.60049号
[14] Montroll,E.W。;Weiss,G.H.,格子上的随机行走II,J.数学。物理。,6, 167-181 (1965) ·Zbl 1342.60067号
[15] Spitzer,F.,《随机行走原理》(1976),施普林格·Zbl 0119.34304号
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