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阿斯格·霍博尔特;Siri-Jégousse，阿诺;莫根斯·布拉特

群体遗传学中的相型分布。 （英文） Zbl 1415.92124号

西奥。大众。生物。 127, 16-32 (2019).
概要：DNA序列进化的概率模型已经建立，并为理解来自一个或多个群体的个体样本之间的遗传变异提供了丰富的框架。我们表明，经典和较新的合并模型（有或无重组）都可以用所谓的相型理论来描述，在这种理论中，使用矩阵操作可以避免复杂和繁琐的计算。相型理论在种群遗传学中的应用包括通过适当地建立状态空间并计算相应的强度和报酬矩阵，将生物系统描述为马尔可夫模型。然后用上述矩阵表示感兴趣的公式。我们通过一些例子来说明这一过程：（a）计算多重合并合并模型中位点频谱的平均值、（co）方差甚至更高阶矩，（b）使用Beta合并分析大西洋鳕鱼的DNA序列样本，以及（c）确定两中心祖先重组图中多个样本的分离位点数量的相关性。我们认为，相型理论作为分析群体遗传学中概率模型的工具具有巨大潜力。紧凑矩阵表示法有助于澄清当前模型，尤其是其形式化操作和计算，也有助于进一步开发或扩展。

引用于14文件

MSC公司：

92D10型 遗传学和表观遗传学

关键词：

合并理论;多重合并;相型理论;复合;隔离场地;现场频谱
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{A.Hobolth}等人，Theor。大众。生物学127，16-32（2019；Zbl 1415.92124）
全文： 内政部 arXiv公司

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