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Elisenda费柳;尼迪·凯恩萨;蒂莫·德·沃尔夫;奥乌尚·尤鲁克

位点磷酸化网络中多稳态的参数区。 （英语） Zbl 1520.92032号

SIAM J.应用。动态。系统。 22，第3期，2024-2053（2023）.
摘要：多位点磷酸化是一种众所周知的信号机制，可产生多个稳态，这一特性称为多稳态。当磷酸化以顺序和分布的方式发生时，我们获得了一系列以磷酸化位点数量为索引的网络。这项工作通过关注这一区域到动力学参数集的投影，解决了理解这一网络家族显示多稳态的参数区域的问题。这个问题是在实代数几何的背景下提出的，并简化为研究一个多项式（定义为大小为3的参数矩阵的行列式）是否在正值上获得负值。多项式的系数是动力学参数的函数。对于任意（n），我们提供了多项式为正的充分条件，从而排除了多重平稳性，也提供了多项式达到负值的充分条件并因此启用多重平稳性。这些条件是通过利用多项式及其牛顿多面体的结构并利用电路多项式推导出来的。我们的结果的一个相关结果是，启用或排除多稳态的动力学参数集都是相互关联的。

引用于1文件

MSC公司：

92立方厘米 系统生物学、网络
92C40型 生物化学、分子生物学
第14页99 实代数和实解析几何

关键词：

磷酸化网络;多平稳性;参数估计;化学反应网络;实代数几何;电路多项式;连通性

软件：

MESSI公司;CoNtRol公司;克伦特温
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{E.Feliu}等人，SIAM J.Appl。动态。系统。22，第3号，2024--2053（2023；Zbl 1520.92032）
全文： DOI程序 arXiv公司

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