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周，Y.C。;大卫·阿古多;弗兰克·V·马可林。;迈克尔·格雷布

利用测地线曲率驱动的蛋白质-膜界面的蛋白质诱导膜形态的计算模型。 （英语） Zbl 07508382号

J.计算。物理学。 422，文章ID 109755，16 p.（2020）.
摘要：嵌入蛋白质诱导的双层膜形态动力学的连续或混合建模需要识别蛋白质-膜界面和耦合两个表面的变形。在本文中，我们开发了（i）用于描述这些界面的最小总测地曲率模型，以及（ii）通过每个曲面到公共中间环的保角映射，在两个曲面之间建立一对一的数值映射。我们的工作为确定双层和嵌入蛋白质之间的界面提供了第一种易于计算的方法。一对一映射允许方便地耦合两个曲面的形态。我们将这两个新的发展集成到蛋白质-膜相互作用的能量模型中，并为耦合系统开发了全套数值方法。通过数值例子证明了（1）我们的方法在高度复杂的蛋白质表面上定位具有最小总测地曲率的曲线的效率和鲁棒性，（2）这些界面作为膜变形内部边界的有用性，以及（3）不同蛋白-膜界面的双层表面的丰富形态。

MSC公司：

92年XX月 生物学和其他自然科学
74-XX岁 可变形固体力学

关键词：

双层膜;蛋白质;接口;测地曲率;表面相场;弹性

软件：

TABI公司;塔比卜
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\textit{Y.C.Zhou}等人，J.Compute。物理学。422，文章ID 109755，16 p.（2020；Zbl 07508382）
全文： 内政部 arXiv公司 链接

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