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迈克尔·劳伦斯;马丁·摩根

可扩展基因组学R（右）和生物导体。 （英语） Zbl 1332.62009年

统计科学。 第214-226号第29页（2014年）.
摘要：本文回顾了在分析大型基因组数据集时解决问题的策略，并描述了这些策略在R（右）由Bioconductor项目的包提供。我们处理大基因组数据的可扩展处理、汇总和可视化。一般思想已经确立，包括限制性查询、压缩、迭代和并行计算。我们通过将Bioconductor软件包应用于检测和分析全基因组测序实验中的遗传变异来演示这些策略。

MSC公司：

62-04 统计相关问题的软件、源代码等
62-07 数据分析（统计）（MSC2010）
62A09号 统计学中的图形方法
92-04 生物相关问题的软件、源代码等

关键词：

R（右）;生物导体;基因组学;生物学;大数据

软件：

GGobi公司;R（右）;foreach公司;生物导体;基因组比对;SoDA公司;biovizBase公司;批处理作业;普利尔;Samtools公司;水管工;VCF工具;生物串;基因组范围;pbdR公司;大Wig;批量实验
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Lawrence}和\textit{M.Morgan}，统计科学。29，第2号，214--226（2014；Zbl 1332.62009）
全文： 内政部 arXiv公司 欧几里得

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