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显性系统发育网络的类别及其生物学和数学意义。 (英语) Zbl 1491.92088号

摘要:生物之间的进化关系传统上是用根系统发生树来表示的。然而,由于杂交或横向基因转移等网状过程,进化不能总是用系统发育树来充分表示,描述这种复杂过程的根系统发育网络被引入为根系统发育树的泛化。事实上,从基因组序列数据估计根系统发育网络并分析其结构特性是当代系统发育学中最重要的任务之一。在过去的二十年里,文献中引入了根系统发育网络的几个亚类(以某些结构约束为特征),以模拟特定的生物现象或进行易于处理的数学和计算分析。在本手稿中,我们对这些网络类进行了彻底的回顾,并尽可能对这些网络背后的结构约束进行了生物学解释。此外,我们讨论了如何利用对网络拓扑施加结构约束来解决从经验数据估计系统发育网络时面临的可扩展性和可识别性挑战。

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92D15型 与进化有关的问题
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