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雨果·拉文纳特;史蒂芬·张;金英熙;杰弗里·希宾格

走向轨迹推理的数学理论。 （英语） Zbl 07829147号

附录申请。普罗巴伯。 34，编号1A，428-500（2024）.
小结：我们设计了一个理论框架和一个数值方法来从随机过程的时间边缘样本推断其轨迹。这个问题出现在单细胞RNA测序数据的分析中，该数据提供了细胞状态的高维测量，但无法跟踪细胞随时间的轨迹。我们证明了对于一类随机过程，可以从每个时间点有限的时间边缘样本中恢复地面真实轨迹，并在实践中提供了一种有效的算法。我们开发的方法Global Waddington-OT（gWOT）归结为一个光滑凸优化问题，该问题在涉及熵正则化最优输运的所有时间点上全局提出。我们证明了这个问题可以在实践中有效地解决，并产生了良好的重建效果，正如我们在几个合成数据集和实际数据集上所显示的那样。

理学硕士：

62M20型 随机过程推断和预测
62G99型 非参数推理
49平方米29 涉及对偶性的数值方法
92立方厘米 发育生物学，模式形成
第49季度22 最佳运输

关键词：

轨迹推断;随机过程;凸优化;最佳运输;发育生物学;单细胞RNA测序

软件：

PyTorch公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{H.Lavenant}等人，Ann.Appl。普罗巴伯。34，编号1A，428--500（2024；Zbl 07829147）
全文： 内政部 arXiv公司 链接

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