×

多维泊松-能斯特-普朗克系统的高效、正和能量稳定方案。 (英语) Zbl 1471.35277号

摘要:在本文中,我们设计、分析并数值验证了求解含时多维泊松-能斯特-普朗克方程组的正格式和能量耗散格式,该格式在生物膜通道和半导体器件的建模中有着广泛的应用。基于系统重构的半隐式时间离散化给出了一个适定椭圆系统,该系统在任意时间步长都能保持解的正性。证明了一阶(时间)全离散格式无条件地保持解的正性和质量守恒,能量耗散仅受温和的(O(1))时间步长限制。该方案还可以保持稳定状态。对于具有较大时间步长的全二阶(时间和空间)格式,通过局部尺度限制器恢复解的正性,这表明可以保持空间精度。这些方案易于实施。几个三维数值算例验证了我们的理论结果,并证明了所提方案的准确性、效率和鲁棒性,以及快速实现稳态的方法。

MSC公司:

92年第35季度 与生物、化学和其他自然科学相关的PDE
35J57型 二阶椭圆方程组的边值问题
35A01型 偏微分方程的存在性问题:全局存在、局部存在、不存在
6500万06 含偏微分方程初值和初边值问题的有限差分方法
65号06 含偏微分方程边值问题的有限差分方法
65号08 含偏微分方程边值问题的有限体积法
65N12号 含偏微分方程边值问题数值方法的稳定性和收敛性
82天37分 半导体统计力学
92B05型 普通生物学和生物数学
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用

参考文献:

[1] Bazant,MZ;桑顿,K。;Ajdari,A.,《电化学系统中的扩散-电荷动力学》,Phys。版本E.,70,021506(2004)·doi:10.1103/PhysRevE.70.012506
[2] 布埃特,C。;Dellacheris,S.,《关于Chang和Cooper格式应用于线性Fokker-Planck方程》,Commun。数学。科学。,8, 1079-1090 (2010) ·Zbl 1208.82043号 ·doi:10.4310/CMS.2010.v8.n4.a15
[3] 汉堡,M。;施莱克,B。;Wolfram,M-T,离子通量通过受限几何体的非线性泊松-能斯特-普朗克方程,非线性,25961-990(2012)·Zbl 1236.92011号 ·doi:10.1088/0951-7715/25/4/961
[4] 陈,J。;LC麦克因斯;Zhang,H.,《柔性BiCGStab的分析和实际应用》,J.Sci。计算。,68, 2, 803-825 (2016) ·Zbl 1372.65097号 ·doi:10.1007/s10915-015-0159-4
[5] 陈,D。;艾森伯格,R.,泊松-能斯特-普朗克(PNP)开放离子通道理论,生物物理。J.,64,A22(1993)
[6] 丁,J。;王,Z。;周,S.,具有空间相互作用的泊松-能斯特-普朗克方程的保正有限差分方法:应用于狭缝状纳米孔电导,J.Compute。物理。,397, 108864 (2019) ·Zbl 1453.65213号 ·doi:10.1016/j.jcp.2019.108864
[7] Eisenberg,B.,生物膜中的离子通道天然纳米管的静电分析,Contemp。物理。,39, 6, 447-466 (1998) ·doi:10.1080/001075198181775
[8] Flavell,A。;M.Machen。;艾森伯格,R。;Kabre,J。;刘,C。;Li,X.,泊松-能斯特-普朗克方程的保守有限差分格式,J.Compute。电子。,15, 1-15 (2013)
[9] Flavell,A。;Kabre,J。;Li,X.,泊松-能斯特-普朗克方程的能量保持离散化,J.Compute。电子。,16, 431-441 (2017) ·doi:10.1007/s10825-017-0969-8
[10] 高,H。;He,D.,Nernst-Planck-Poisson方程的线性化保守有限元方法,J.Sci。计算。,72, 1269-1289 (2017) ·Zbl 1378.65168号 ·doi:10.1007/s10915-017-0400-4
[11] 加德纳,C。;诺纳,W。;艾森伯格,RS,《离子通道的电扩散模型模拟:一维模拟》,J.Compute。电子。,3, 25-31 (2004) ·doi:10.1023/B:JCEL.0000029453.09980.fb
[12] Gillespie,D。;诺纳,W。;艾森伯格,RS,带电硬球流体的密度泛函理论,物理学。E版,68,0313503(2003)·doi:10.1103/PhysRevE.68.031503
[13] Gilbarg,D.,Trudinger,N.S.:二阶椭圆偏微分方程。Grundlagen der mathematischen Wissenschaften,第224卷,柏林施普林格出版社(1997)
[14] He,D。;Pan,K.,泊松-能斯特-普朗克系统的能量守恒有限差分格式,应用。数学。计算。,287, 214-223 (2016) ·Zbl 1410.65311号
[15] He,D。;潘,K。;Yue,X.,泊松-能斯特-普朗克系统的保正自由能耗散差分格式,J.Sci。计算。,81, 436-458 (2019) ·兹比尔1427.65165 ·doi:10.1007/s10915-019-01025-x
[16] Hu,J.W.,Huang,X.D.:泊松-能斯特-普朗克方程的全离散保正耗能有限差分格式。预印本(2019年)·Zbl 1442.35459号
[17] Hyon,Y。;艾森伯格,B。;Liu,C.,离子溶液中硬球斥力的数学模型,Commun。数学。科学。,9, 2, 459-475 (2011) ·Zbl 1406.76089号 ·doi:10.4310/CMS.2011.v9.n2.a5
[18] Jerome,JW,《半导体建模的一致性:饱和Van Roosbroeck系统的存在性/稳定性分析》,SIAM J.Appl。数学。,45, 4, 565-590 (1985) ·Zbl 0611.35026号 ·数字对象标识代码:10.1137/0145034
[19] 季S。;Liu,W.,离子流的泊松-能斯特-普朗克系统与硬球势的密度泛函理论:I-V关系和临界势。第一部分:分析,J.Dyn。不同。等于。,24, 955-983 (2012) ·Zbl 1270.93011号 ·doi:10.1007/s10884-012-9277-y
[20] Li,B.,非均匀离子尺寸离子溶液的连续静电,非线性,22811-833(2009)·Zbl 1160.35383号 ·doi:10.1088/0951-7715/22/4/007
[21] Liu,W.,稳态泊松-能斯特-普朗克系统的几何奇异摄动方法,SIAM J.Appl。数学。,65, 3, 754-766 (2005) ·Zbl 1079.34044号 ·doi:10.1137/S0036139903420931
[22] 刘,H。;Maimaitiyiming,W.,约化泊松-能斯特-普朗克系统的能量稳定和无条件正格式,Commun。计算。物理。,7, 5, 1505-1529 (2020) ·Zbl 1473.65263号
[23] 刘,H。;Maimaitiyiming,W.,带相互作用势扩散的正能量和自由能满足方案,J.Compute。物理。,419, 109483 (2020) ·Zbl 07507217号 ·doi:10.1016/j.jcp.2020.109483
[24] 刘,H。;Yu,H.,有限可扩展非线性弹性哑铃模型Fokker-Planck方程的一种满足熵的保守方法,SIAM J.Numer。分析。,50, 3, 1207-1239 (2012) ·Zbl 1422.74097号 ·数字对象标识代码:10.1137/10829611
[25] 刘,H。;Wang,Z.,泊松-能斯特-普朗克方程的满足自由能的有限差分方法,J.Compute。物理。,268, 363-376 (2014) ·Zbl 1349.65317号 ·doi:10.1016/j.jp.2014.02.036
[26] 刘,H。;Wang,Z.,一维泊松-能斯特-普朗克系统的满足自由能的间断Galerkin方法,J.Compute。物理。,328, 413-437 (2017) ·Zbl 1406.82021号 ·doi:10.1016/j.jcp.2016.10.008
[27] 刘,X。;乔,Y。;Lu,B.,具有非均匀边界条件的电解质溶液的平均场自由能泛函分析和具有非均匀介电常数的广义PB/PNP方程,SIAM J.Appl。数学。,78, 2, 1131-1154 (2018) ·兹伯利1388.35019 ·doi:10.1137/16M1108583
[28] 卢,B。;霍尔斯特,MJ;JA麦卡蒙;Zhou,Y.,用于模拟生物分子扩散反应过程的泊松-能斯特-普朗克方程I:有限元解,J.Compute。物理。,229, 6979-6994 (2010) ·Zbl 1195.92004号 ·doi:10.1016/j.jcp.2010.05.035
[29] 宾夕法尼亚州马科维奇;加利福尼亚州林格霍夫;Schmeiser,C.,《半导体方程》(1990),柏林:施普林格出版社,柏林·Zbl 0765.35001号 ·doi:10.1007/978-3-7091-6961-2
[30] 孟,D。;Zheng,B。;林·G。;Sushko,ML,三维泊松-能斯特-普朗克方程的数值解与经典密度泛函理论耦合,用于模拟受限环境中的离子和电子传输,Commun。计算。物理。,16, 1298-1322 (2014) ·兹比尔1388.65134 ·doi:10.4208/cicp.040913.120514a
[31] 梅蒂,理学硕士;徐,J。;Liu,C.,电荷传输和电动模型的能量稳定离散,J.Compute。物理。,306, 1-18 (2016) ·Zbl 1351.78040号 ·doi:10.1016/j.jcp.2015.10.053
[32] Newman,J.,《电化学系统》(1991),纽约:普伦蒂斯·霍尔,纽约
[33] 公园,J-H;Jerome,J.,稳态泊松-能斯特-普朗克系统的定性性质:数学研究,SIAM J.应用。数学。,57, 3, 609-630 (1997) ·Zbl 0874.34017号 ·doi:10.1137/S00361399995279809
[34] 普罗特,MH;Weinberger,HF,《微分方程中的最大值原理》(1967),纽约:普伦蒂斯·霍尔出版社,纽约·兹伯利0153.13602
[35] 钱,Y。;王,Z。;Zhou,S.,多维非局部Fokker-Planck方程的守恒、自由能量耗散和保正的有限差分格式,J.Compute。物理。,386, 22-36 (2019) ·兹比尔1452.65174 ·doi:10.1016/j.jcp.2019.02.028
[36] Saad,Y.,《一种灵活的内外预处理GMRES算法》,SIAM J.Sci。计算。,14, 2, 461-469 (1993) ·Zbl 0780.65022号 ·doi:10.1137/0914028
[37] Selberherr,S.,《半导体器件的分析与模拟》(1984),纽约:Springer,纽约·doi:10.1007/978-3-7091-8752-4
[38] Siddiqua,F。;王,Z。;Zhou,S.,排除体积效应的修正Poisson-Nernst-Planck模型:理论和数值实现,Commun。数学。科学。,16, 1, 251-271 (2018) ·Zbl 1395.92015年 ·doi:10.4310/CMS.2018.v16.n1.a12
[39] 索卡尔斯基,T。;Lewenstam,A.,《能斯特-普朗克和泊松方程在实时和空间域中解释液结和膜电位的应用》,《电化学》。社区。,3, 3, 107-112 (2001) ·doi:10.1016/S1388-2481(01)00110-2
[40] 索卡尔斯基,T。;Lingenfelter,P。;Lewenstam,A.,液结和离子选择性膜电位耦合能斯特-普朗克和泊松方程的数值解,J.Phys。化学。B、 107、11、2443-2452(2003)·doi:10.1021/jp026406a
[41] 马里兰州苏什科;罗索,KM;张,J-GJ;Liu,J.,固体电解质中锂离子电导率的多尺度模拟,化学。物理学。莱特。,2, 2352-2356 (2011) ·doi:10.1021/jz201032w
[42] Teorell,T.,离子膜中的传输过程和电现象,Prog。生物物理学。,3, 305 (1953)
[43] 魏,GW;郑琦。;陈,Z。;Xia,K.,电荷传输的变分多尺度模型,SIAM Rev.,54,699-754(2012)·Zbl 1306.92021号 ·数字对象标识代码:10.1137/10845690
[44] 尹,P。;黄,Y。;Liu,H.,求解非线性Poisson-Boltzmann方程的迭代间断Galerkin方法,Commun。计算。物理。,16, 491-515 (2014) ·Zbl 1388.65162号 ·doi:10.4208/cicp.270713.280214a
[45] 尹,P。;黄,Y。;Liu,H.,非线性Poisson-Boltzmann方程的迭代间断Galerkin方法的误差估计,Commun。计算。物理。,23, 168-197 (2018) ·Zbl 1488.65669号 ·doi:10.4208/cicp。OA-2016-0226
[46] 郑琦。;陈,D。;Wei,G-W,离子传输的二阶泊松-能斯特-普朗克解算器,J.Compute。物理。,230, 5239-5262 (2011) ·Zbl 1222.82073号 ·doi:10.1016/j.jcp.2011.03.020
[47] 郑琦。;Wei,GW,Poisson-Boltzmann-Nernst-Planck模型,J.Chem。物理。,134, 194101 (2011) ·doi:10.1063/1.3581031
[48] 周,J。;姜瑜。;Doi,M.,交叉作用驱动二元胶体混合物干燥膜的分层,Phys。修订稿。,10, 108002 (2017) ·doi:10.1103/PhysRevLett.118.108002
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。