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罗曼·里维埃;多米尼克·巴特;约翰·科恩;阿兰·丹尼斯

用模体约束来混乱生物序列。 （英语） Zbl 1145.92314号

J.离散算法 192-204年第2期第6期（2008年）.
小结：我们研究了以下问题：给定一个生物序列（S）、一个多序列基序集（M）和一个整数（k），生成包含给定基序且具有与（S）完全相同的（k）-let（即长度因子）出现频率的均匀随机序列。我们特别证明了决定序列是否遵守给定基序约束的问题是NP完全的。然而，我们给出了一种随机生成算法，实验证明它是有效的。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
65年第68季度 算法和问题复杂性分析
92-08 生物学问题的计算方法

关键词：

随机序列生成;NP-完整性

软件：

爆炸;PSI-爆炸
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{R.Rivière}等人，J.离散算法6，No.2，192--204（2008；Zbl 1145.92314）
全文： DOI程序

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