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从编码、几何和保护三个方面对3D分形DNA进行组装。 (英语) Zbl 1061.68163号

摘要:我们提出了DNA组件,其3D几何形状和内聚部分与分形3D组装兼容。DNA平行四边形是由A.碳北卡罗来纳州西曼【国家计算1,469–480(2002;Zbl 1020.68080号),自然计算。2, 133–151 (2003;Zbl 1058.68094号)]作为Sierpinski地毯2D分形装配的合适构建块。在这里,我们使用Mao 3D三角形(即3D几何三角分子)来构建基本的构建块,并获得了2D装配设计的简化版本。与之前的2D结构一样,我们利用编码的相互作用,以内聚端的形式、几何互补性和潜在不良反应性位点的保护。我们提出的模式适用于三角对称,而毛三角是可能的DNA三角瓦的一个例子。

MSC公司:

68单位05 计算机图形;计算几何(数字和算法方面)
92D20型 蛋白质序列,DNA序列
28A80型 分形
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