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后缀向量:一种节省空间的后缀树表示。 (英语) 兹比尔1077.68646

Peter Eades等人,《算法与计算》。2001年12月19日至21日在新西兰基督城举行的第十二届国际研讨会,ISAAC 2001。诉讼程序。柏林:施普林格出版社(ISBN 3-540-42985-9)。莱克特。注释计算。科学。2223, 707-718 (2001).
摘要:本文介绍了一种表示后缀树的新方法。表示法背后的基本思想是,我们将树的节点与字符串本身一起存储,因此可以直接从字符串中读取边缘标签。新的表示法所占用的空间小于迄今为止最著名的表示法,例如英语文本和程序文件,虽然在DNA序列的情况下需要更多的空间。我们还相信,我们的表示更清晰,因此在其上实现算法更容易。我们还表明,我们的表示不仅在空间方面更好,而且从树中检索信息也更快。我们从理论上比较了匹配统计算法在两种表示上的运行时间。
关于整个系列,请参见[Zbl 0983.00057号].

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2005年第68季度 计算模型(图灵机等)(MSC2010)
68第05页 数据结构
92D20型 蛋白质序列,DNA序列
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