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坐下，阿提拉;吴志军

求解蛋白质结构测定的广义距离几何问题。 （英语） Zbl 1402.92333号

牛市。数学。生物。 73，第12号，2809-2836（2011）.
摘要：我们提出了一种新的方法来解决核磁共振蛋白质建模中使用一组原子间距离界限确定蛋白质结构集合的问题。与X射线晶体学类似，我们假设蛋白质具有平衡结构，原子在其平衡位置附近波动。然后，该问题可以表示为一个广义距离几何问题，以确定蛋白质中原子的平衡位置和最大可能涨落半径，前提是涨落应在给定的距离范围内。我们描述了这项工作的科学背景、新方法的动机和问题的提出。我们开发了一种几何构建算法来近似解决该问题，并给出了一些初步的测试结果，作为第一步的概念验证。我们还讨论了相关的理论和计算问题，以及这项工作在NMR蛋白质建模中的潜在影响。

引用于4文件

理学硕士：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列
51K05美元 距离几何的一般理论

关键词：

生物分子模型;蛋白质结构测定;分子距离几何;线性和非线性方程组;约束和无约束优化

软件：

中枢神经系统
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{A.坐}和\textit{Z.Wu}，公牛。数学。生物学73，第12期，2809--2836（2011；Zbl 1402.92333）
全文： 内政部

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