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M·孙。;乔普林，M.A。;D.塔利恩。;普拉姆斯塔勒，P。;T·埃格兰。;新泽西州希恩。

关于使用密集SNP标记数据识别远亲对。 （英语） Zbl 1343.92369号

理论。大众。生物。 107, 14-25 (2016).
摘要：最近人们对利用现成的密集基因组扫描标记数据来鉴定亲属产生了兴趣。然而，关于这些数据在实际情况中的信息量有多大，存在着相互矛盾的发现，尤其是在没有具体理由证明所选间距的情况下，经常使用稀疏标记集。我们探讨了密集单核苷酸多态性（SNP）阵列在该应用中的潜在用途，重点是推断远亲对。我们区分关系估计（由连接两个感兴趣的个体的系谱定义）和一般关联性估计（由亲属关系系数或关联性系数提供）。由于我们主要关注的是前一个案例，所以我们采用了系谱似然法。我们考虑了附加SNP和数据对附加类型亲属的影响，以及该亲属的选择对关系推断的影响。我们还考虑了联系不平衡的影响。当总体相关性而非具体关系足够时，我们提出了一种易于实现的近似方法，似乎与流行的基于矩的估计量和最近基于染色体共享的最大似然方法有很好的竞争。我们的结论是，密集的标记数据对远亲来说信息更丰富。然而，联系不平衡不容忽视，它将成为实际数据应用的主要限制因素。

MSC公司：

92D15型 与进化有关的问题
92D10型 遗传学和表观遗传学
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析

关键词：

关系;相关性;血统;可能性;贝叶斯定理

软件：

哈普洛维;从法医学角度;詹蒂;弗兰兹
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Sun}等人，Theor。大众。生物学107，14-25（2016；Zbl 1343.92369）
全文： 内政部 链接

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