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迪米特里·苏尔梅利;奥利弗·拉特曼;汉斯·沃纳（Hans-Werner Mewes）;伊戈尔·泰特科。

具有信念传播和特征集成的FunCat函数推理。 （英语） Zbl 1161.92029号

计算。生物化学。 32，第5号，375-377（2008）.
摘要：序列数据的成对比较被广泛用于自动功能蛋白注释，而图形模型则成为各种异质特征集成的理想候选。我们设计了一个模型，称为hRMN，它集成了不同的基因组特征，并实现了一种用于功能注释转移的信念传播变体。hRMN允许分配多个功能类别，同时避免了来自异构数据集的注释传输中的常见问题，例如所调查数据集的独立性。我们使用大规模注释转移（基于MIPS FunCat本体论）对原核生物枯草芽孢杆菌、幽门螺杆菌、单核细胞增生李斯特菌和innocua李斯特菌的蛋白质进行了基准测试。hRMN在四个细菌基因组注释方面始终优于两个竞争对手。开发的代码可从以下网址下载：http://mips.gsf.de/project/bfab/hRMN.html.

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92-08 生物学问题的计算方法

关键词：

自动功能注释;信仰传播;细菌基因组;异构数据源;概率图形模型
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{D.Surmeli}等人，计算。生物化学。32，第5号，375--377（2008；Zbl 1161.92029）
全文： 内政部

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