奥维迪乌·拉杜列斯库;安妮·西格尔;伊丽莎白·佩库;克莱门·查特兰;Sandrine Lagarrigue公司 基因调控的代谢网络：Gale-Nikaido模块和微分不等式。 （英语） Zbl 1326.92029号 Priami，Corrado（编辑）等人，《计算系统生物学汇刊XIII》。柏林：施普林格出版社（ISBN 978-3-642-19747-5/pbk）。计算机科学讲义6575。生物信息学讲义。《期刊副刊》，110-130（2011）。 摘要：我们提出了一种研究具有遗传调控的代谢网络静态特性的方法。我们的结果基于微分不等式，这些微分不等式是对反应速率函数偏导数值的约束。该方法对涉及满足Gale-Nikaido全局单价性质的代数模块的稳态方程使用迭代消元法。同样的方法可以找到唯一稳态的条件。在代谢途径的情况下，部分消除变量可以产生几个替代模型，从而比较有和没有遗传调控的代谢产物的稳态变化。关于整个系列，请参见[Zbl 1214.92032号]. MSC公司： 92立方厘米 系统生物学、网络 34A40号 涉及单个实变量函数的微分不等式 关键词：系统生物学;代谢控制;遗传调节;质量约束;单价性 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{O.Radulescu}等人，Lect。注释计算。科学。6575、110-130（2011年；Zbl 1326.92029） 全文： 内政部 参考文献： [1] Blavy，P.，Gondret，F.，Guillou，H.，Lagarrigue，S.，Martin，P.G.P.，van Milgen，J.，Radulescu，O.，Siegel，A.：禁食期间肝脏脂肪酸平衡的最小模型：应用于PPARα缺陷小鼠。理论生物学杂志261（2），266-278（2009）·doi:10.1016/j.jtbi.2009.07.025 [2] Barnouin，S.，Lassere，F.，Cantiello，M.，Guillou，H.，Pineau，T.，Martin，P.：禁食期间野生型和PPAR{\（\α\）}-/-小鼠基因表达和代谢的协调调节动力学视图。参加：保罗·哈默尔研究所会议，摩纳哥（2004年） [3] Cornish-Bowden，A.：酶动力学基础。波特兰出版社，伦敦（1995）·Zbl 0861.92015号 [4] Clément，K.，Ferré，P.：肥胖的遗传学和病理生理学。儿科研究53，721–725（2003）·doi:10.1203/01.PDR.0000059753.61905.58 [5] Craciun，G.，Tang，Y.，Feinberg，M.：理解复杂酶驱动反应网络中的双稳态。国家科学院院刊103（23），8697（2006）·Zbl 1254.93116号 ·doi:10.1073/pnas.0602767103 [6] Duples，E.，Forest，C.：脂肪酸调节基因转录是否存在单一机制？生物化学药理学64，893–901（2004）·doi:10.1016/S0006-2952（02）01157-7 [7] Fell，D.：了解新陈代谢的控制。波特兰出版社，伦敦（1997） [8] Jump，D.B.：脂肪酸对基因转录的调节。临床实验室科学评论。 41, 41–78 (2004) ·doi:10.1080/10408360490278341 [9] Kitayama，T.、Kinoshita，A.、Sugimoto，M.、Nakayama，Y.、Tomita，M.：根据时间进程数据和稳态通量曲线对代谢途径进行幂律建模的简化方法。理论生物学和医学建模3，24（2006）·doi:10.1186/1742-4682-3-24 [10] Lee，S.等：能量剥夺期间维持磷脂和三甘油稳态的PPAR要求。《脂质研究杂志》2025-2037年第4期（2004年）·doi:10.1194/jlr。M400078-JLR200 [11] Lee，J.M.，Gianchandani，E.P.，Papin，J.A.：代谢组学时代的通量平衡分析。生物信息学简报7（2），140（2006）·doi:10.1093/bib/bbl007 [12] Parthasarathy，T.：关于整体单价定理。数学课堂讲稿，第977卷。斯普林格，海德堡（1983）·Zbl 0506.90001号 ·doi:10.1007/BFb0065566 [13] Pégorier，J.-P.，Le May，C.：基因表达调控（通过脂肪酸控制基因表达）。《营养学杂志》17、80–88（2003）·doi:10.1016/S0985-0562（03）00027-X [14] Radulescu，O.，Gorban，A.N.，Zinovyev，A.，Lilienbaum，A.：多尺度生化网络的稳健简化。BMC系统生物学2（1），86（2008）·数字对象标识代码：10.1186/1752-0509-2-86 [15] Radulescu，O.，Lagarrigue，S.，Siegel，A.，Veber，P.，Le Borgne，M.：分子生物学中相互作用网络的拓扑和线性响应。《皇家学会界面杂志》3（6），185-196（2006）·doi:10.1098/rsif.2005.0092 [16] Savageau，M.A.，Voit，E.O.：将非线性微分方程重铸为S系统：标准非线性形式。数学生物科学87（1），83–115（1987）·Zbl 0631.34015号 ·doi:10.1016/0025-5564（87）90035-6 [17] 托马斯·R：关于系统的逻辑结构与其产生多个稳态或持续振荡的能力之间的关系。斯普林格爵士。协同学9，180–193（1981）·doi:10.1007/978-3-642-81703-8_24 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。