冯、宋;艾米丽·希思;布雷特·杰斐逊;克利夫·乔斯林;亨利·科文奇;休·D·米切尔。;布伦达·布拉加斯蒂斯;艾米·艾斯菲尔德。;艾米·西姆斯。;拉里萨·B·萨克雷。;范淑芳;凯文·沃尔特斯。;彼得·霍夫曼。;丹妮尔·韦斯特霍夫·史密斯;谭青;维尼特·梅纳切里。;蒂莫西·谢汉（Timothy P.Sheahan）。;亚当·科克雷尔。;雅各布·科彻。;凯利·斯特拉顿（Kelly G.Stratton）。;娜塔莉·海勒。;丽莎·布拉默（Lisa M.Bramer）。;迈克尔·戴蒙德。;拉尔夫·巴里克。;卡特里娜·M·沃特斯。;川冈、吉弘;杰森·麦克德莫特。;埃米莉·普文 生物网络超图模型，用于识别对致病性病毒反应至关重要的基因。 arXiv:2010.03068号 预印本，arXiv:2010.03068[q-bio.QM]（2020）。 摘要：背景：将生物网络表示为图形是从高通量生物分子数据中揭示潜在模式、特征和关键成分的有力方法。然而，图形并不能自然地捕捉生物系统中基因和蛋白质之间的多向关系。超图是自然地模拟多向关系的图的泛化，在模拟蛋白质复合物和代谢反应等系统方面显示出了良好的前景。在这篇论文中，我们试图了解超图如何基于从基因组表达数据集推断出的复杂关系，更忠实地识别并潜在地预测重要基因。结果：我们编译了一组新的宿主对致病性病毒感染的转录反应数据集，并将基因之间的关系表示为超图，其中超边表示显著受干扰的基因，顶点表示具有特定实验条件的个体生物样本。我们发现，与图中心性相比，超图中间性中心性是识别病毒反应重要基因的一种优越方法。结论：我们的结果证明了使用超图表示复杂生物系统的实用性，并强调了对各种高致病性病毒的共同重要中枢反应。 MSC公司： 92立方厘米 系统生物学、网络 92-08 生物学问题的计算方法 05C65号 Hypergraphs（Hypergraph） BibTeX公司 引用 \textit{S.Feng}等人，“识别致病性病毒反应关键基因的生物网络超图模型”，预印本，arXiv:2010.03068[q-bio.QM]（2020） 全文： arXiv公司 OA许可证 arXiv数据来自arXiv OAI-PMH API.如果你发现了错误，请直接向arXiv报告.