尼古拉·贝索诺夫;Gennady Bocharov;安德烈亚斯·梅耶汉斯;弗拉基米尔·波波夫;维塔利·沃尔珀特 病毒进化的非局部反应扩散模型中菌株的存在和动力学。 （英语） Zbl 1458.35417号 SIAM J.应用。数学。 81，编号107-128（2021）. 小结：在这项工作中，我们开发了一个数学框架，用于预测和量化宿主生物感染期间病毒多样性的演变。它被指定为与基因型和时间有关的病毒密度分布，由反应扩散积分微分方程控制，其中考虑了病毒的突变、复制和免疫细胞的消除以及药物治疗。确定了与基因型空间中的局部密度分布相对应的病毒株存在的条件。研究表明，诸如多样化和灭绝等常见病毒进化特征是由免疫反应、靶细胞间竞争和治疗等非局部相互作用驱动的。这为我们提供了一个临床相关特性（如免疫逃逸和耐药性选择）的机制解释，并允许我们将病毒基因型与表型联系起来。 引用于2文件 MSC公司： 92年第35季度 与生物、化学和其他自然科学相关的PDE 35K57型 反应扩散方程 35卢比 积分-部分微分方程 92D25型 人口动态（一般） 92立方厘米 发育生物学，模式形成 92 C50 医疗应用（通用） 关键词：病毒密度分布;基因型;病毒感染;免疫反应;抗治疗性;非局部相互作用 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{N.Bessonov}等人，SIAM J.Appl。数学。81、第1号、第107-128号（2021年；Zbl 1458.35417） 全文： 内政部 参考文献： [1] H.K.Alexander和S.Bonhoeffer，宿主内病毒动力学广义模型中耐药性的存在与出现，《流行病学》，4（2012），第187-202页。 [2] M.Alfaro、J.Coville和G.Raoul，非局部反应扩散方程的双稳态行波，离散Contin。动态。系统。，34（2014），第1775-1791页·Zbl 1278.45012号 [3] M.Alfaro、A.Ducrot和T.Giletti，带时滞的非单调双稳态方程的行波：存在性和振动，Proc。伦敦。数学。Soc.（3），116（2018），第729-759页·Zbl 1387.35087号 [4] M.Banerjee和V.Volpert，Rosenzweig-Macarthur模型中的时空模式形成：非局部相互作用的影响，Ecol。复杂。，30（2017年），第2-10页。 [5] H.Berestycki、L.Nirenberg和S.R.S.Varadhan，一般域中二阶椭圆算子的主特征值和最大值原理，Comm.Pure Appl。数学。，47（1994年），第47-92页·Zbl 0806.35129号 [6] C.K.Biebricher和M.Eigen，什么是准物种？，货币。顶部。微生物。免疫学。，299（2006），第1-31页。 [7] G.Bocharov、V.Volpert、B.Ludewig和A.Meyerhans，《病毒感染的数学免疫学》，查姆斯普林格出版社，2018年·Zbl 1401.92002号 [8] G.Bocharov、A.Meyerhans、N.Bessonov、S.Trofimchuk和V.Volpert，病毒感染在组织中传播的时空动力学，《公共科学图书馆·综合》，12（2016），e0168576，https://doi.org/10.1371/journal.pone.0168576。 ·Zbl 1406.92553号 [9] G.Bocharov、A.Meyerhans、N.Bessonov、S.Trofimchuk和V.Volpert，《模拟病毒感染和免疫反应在空间和时间上的动态》，国际期刊《并行紧急分发系统》。，34（2019年），第341-355页。 [10] N.F.Britton，积分-微分反应扩散种群模型中的空间结构和周期行波，SIAM J.Appl。数学。，6（1990），第1663-1688页，https://doi.org/10.1137/0150099。 ·Zbl 0723.92019号 [11] P.Buzon、S.Maity和W.H.Roos，《物理病毒学：从病毒自组装到粒子力学》，WIREs Nanomed。纳米生物技术。，12（2020年），e1613。 [12] J.Coffin和R.Swanstrom，《HIV发病机制：病毒种群和感染细胞的动力学和遗传学》，《冷泉港》。透视。《医学》，3（2013），a012526。 [13] E.Domingo、J.Sheldon和C.Perales，《病毒准种，进化微生物》。分子生物学。第76版（2012年），第159-216页 [14] N.Echeverriáa、G.Moratorio、J.Cristina和P.Moreno，丙型肝炎病毒遗传变异性和进化，世界肝病杂志。，7（2015），第831-845页。 [15] R.A.Fisher，优势基因的发展浪潮，Ann.Eugen。，7（1937），第355-369页，https://doi.org/10.1111/j.1469-1809.1937.tb02153.x。 [16] A.Friedman和W.Hao，动脉粥样硬化与胆固醇反向转运及相关风险因素的数学模型，Bull。数学。《生物学》，77（2015），第758-781页·Zbl 1334.92198号 [17] S.D.Frost、T.Wrin、D.M.Smith、S.L.Kosakovsky Pond、Y.Liu、E.Paxinos、C.Chappey、J.Galovich、J.Beauchaine、C.J.Petropoulos、S.J.Little和D.D.Richman，《抗体反应在近期HIV感染期间推动人类免疫缺陷病毒1型包膜的进化》，Proc。国家。阿卡德。科学。，2005年第102期，第18514-18519页。 [18] A.Gallimore、H.Hengartner和R.Zinkernagel，抗原特异性细胞毒性T细胞反应的层次，免疫学。修订版，164（1998），第29-36页。 [19] S.Genieys、V.Volpert和P.Auger，《自适应动力学：达尔文发散原理建模》，C.R.Biol。，329，（2006），第876-879页。 [20] S.A.Gourley、M.A.J.Chaplain和F.A.Davidson，非局部反应扩散方程中的时空模式形成，Dyn。系统。，16（2001），第173-192页·Zbl 0988.35082号 [21] W.Hao、L.S.Schlesinger和A.Friedman，《肺部感染引起的肉芽肿建模》，《公共科学图书馆·综合》，11（2016），e0148738。 [22] Y.Haraguchi和A.Sasaki，宿主内病原体抗原漂移的进化模式：免疫反应中交叉反应的影响，Philos。事务处理。R.Soc.伦敦。生物科学B。，352（1997），第11-20页。 [23] M.Kimura，种群遗传学中的扩散模型，J.Appl。《概率》，1（1964年），第177-232页·Zbl 0134.38103号 [24] E.M.Kolawole、R.Andargachew、B.Liu、J.R.Jacobs和B.D.Evavold，LCMV GP33表位TCR和CD8共受体的动力学分析，Front。免疫学。，9（2018），2348。 [25] A.Kolmogorov、I.Petrovskii和N.Piskunov，《物质数量增加时扩散方程的研究及其在生物问题中的应用》，载于A.N.Kolmogoriv I，V.M.Tikhomirov，ed.，Kluwer，1991年，第248-270页；由V.M.Volosov从Bull翻译。莫斯科大学数学系。机械。，1（1937），第1-25页。 [26] G.Lawyer、A.Altmann、A.Thielen、M.Zazzi、A.Soñnnerburg和T.Lengauer，多药治疗下的HIV-（1）突变途径，艾滋病研究与治疗。，8 (2011), 26. 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