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康、凌;李洪林;赵晓宇;蒋华良;王西成

一种新的基于结构药物设计的构象优化模型和算法。 （英语） Zbl 1165.92014年

数学杂志。化学。 46，第1期，182-198（2009）.
摘要：我们提出了分子对接的多尺度优化模型和基于熵的遗传算法。在这个模型中，我们在精细对接设计中引入了基于诱导fit的残基概念，并采用了不同尺度的构象组合。为了解决分子对接的优化问题，提出了一种新的迭代方案，并结合多种群进化策略、一种基于熵的搜索技术以及缩小空间和准精确罚函数。此外，还开发了一种新的对接程序，用于解释蛋白质的灵活性。对接结果表明，该方法可以有效地用于基于结构的药物设计。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
90 C59 数学规划中的近似方法和启发式
92 C50 医疗应用（通用）

关键词：

信息熵;遗传算法;分子对接;多尺度优化模型;残基

软件：

SYBYL公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit｛L.Kang｝等人，数学杂志。化学。46，第1号，182--198（2009；Zbl 1165.92014）
全文： 内政部

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