钟，明;张一伟;肯尼思·兰格;范汝宗 一种基于交叉群体扩展单倍型的纯合子得分测试，用于检测全基因组扫描中的阳性选择。 （英语） Zbl 1245.62169号 统计接口 4，第1号，51-63（2011）. 摘要：我们开发了一个跨群体比较检验统计数据，以检测一个群体中没有显著的超纯合子，但另一个群体的纯合子仍然很高的染色体区域。我们将纯合子延伸作为近期阳性选择的替代指标。在现有连锁不平衡的条件下，我们建议测试Hardy-Weinberg平衡（HWE）的单倍型版本。对于每个群体，我们假设不相关个体的随机样本根据大量单核苷酸多态性（SNP）进行分型。通过比较核心SNP周围两个样本的纯合性测量值，构建了一个汇总测试统计数据。在染色体区域中，HWE在一个群体中大致正确，而在另一个群体则不正确，混合测试统计结果显著，可检测阳性选择。我们通过以下方式评估测试统计的性能I型误差比较和功率评估。我们表明，所提出的检验统计量非常保守，当所选等位基因保持多态性时，它具有很好的功效。然后，我们将测试应用于HapMap Phase II数据，与以前的结果进行比较，并搜索新的候选区域。 MSC公司： 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 92C40型 生物化学、分子生物学 62号03 生存分析和审查数据中的测试 92D10型 遗传学和表观遗传学 关键词：扩展纯合子 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.Zhong}等人，Stat.Interface 4，No.1，51--63（2011；Zbl 1245.62169） 全文： DOI程序