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黄，李;金洪均;雅各布·弗斯特;丹尼尔·雷库

一种用于路径分析的运行长度编码方法秀丽线虫搜索行为。 （英语） Zbl 1358.92025号

计算。数学。方法医学。 2016年，文章ID 3516089，9 p.（2016）.
小结：线虫秀丽隐杆线虫使用不同运动模式的组合探索环境，包括直线运动、反转和转弯。我们建议量化秀丽线虫使用基于步长数据的行程编码的计算机视觉方法的运动行为。在这种方法中秀丽线虫编码为字符串，其中每个字符表示特定类型移动的路径段。利用这些编码字符串数据，我们进行了“（k）均值”聚类分析，以区分不同基因型和食物可用性导致的运动行为。我们发现，浅转弯和急转弯是区分运动行为差异的最关键因素。为了验证我们的方法，我们检查了tph-1型缺乏负责血清素生物合成的酶的突变体。使用路径字符串编码数据进行的A（k）-均值聚类分析表明tph-1型运动食物上的行为与野生动物不进食的行为相似。我们建议，这种行程编码方法适用于动物或人类移动数据中的轨迹数据。

MSC公司：

92立方厘米 生物力学
92C99型 生理、细胞和医学主题
92-08 生物问题的计算方法

关键词：

秀丽隐杆线虫;急转弯;字符串数据;运动行为
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{L.Huang}等人，计算。数学。方法医学2016，文章ID 3516089，9 p.（2016；Zbl 1358.92025）
全文： 内政部

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