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按蚊免疫反应相关基因调控的定量研究:贝叶斯层次聚类曲线的应用。 (英语) Zbl 1118.62368号

概要:疟疾是全球公共卫生面临的主要挑战之一。疟疾寄生虫恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)和蚊子媒介(一种传播传染病的生物)按蚊的基因组注释是该疾病研究的最近突破。特别令人感兴趣的是疟原虫免疫反应系统的分子生物学基础,该系统积极对抗疟原虫感染。本文报告了对感染细菌制剂的蚊子的基因表达时间曲线的统计分析。具体来说,我们引入了一种基于贝叶斯模型的曲线数据层次聚类算法,以研究相关基因的调控机制;也就是说,我们的目标是聚集具有相似表达谱的基因。然后,可以突出显示显示类似有趣特征的基因,以供实验者进一步研究。我们展示了我们的方法如何揭示其他方法无法捕获的数据中的结构。数据中最相关的特征之一是样本量,它记录了2771个基因在6个时间点的表达水平。此外,时间点的间隔不均匀,基因图谱中存在预期的非平稳行为。我们证明了我们的方法在这些条件下易于实现,并强调了在完全贝叶斯分析的背景下可以节省一些关键的计算量。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
92C60型 医学流行病学
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全文: 内政部