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胡安·尼托。;A.托雷斯。;D.N.乔治奥。;卡拉卡西迪斯，T.E。

模糊多核苷酸空间和度量。 （英语） Zbl 1334.92275号

牛市。数学。生物。 68，第3期，703-725（2006）.
摘要：基因序列的研究在生物学和医学中具有重要意义。数学在遗传序列研究和生物信息学研究中发挥着重要作用。本文扩展了[前两位作者，“模糊多核空间：基本属性”，生物信息学19，No.5，587-592（2003）和第一位作者等人，《应用数学快报》16，No.8，1289-1294（2003；Zbl 1106.92307号)]通过使用几个指标研究核苷酸和一些完整基因组之间的距离。我们还提出了关于多核苷酸之间相似性、差异性和相等性概念的新结果。这些结果令人鼓舞，因为它们证明了FPS中多核苷酸之间的距离和相似性概念如何应用于遗传物质的分析。

引用于8文件

MSC公司：

92D10型 遗传学和表观遗传学
92C40型 生物化学、分子生物学
92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

DNA;核糖核酸;多聚核苷酸;模糊集;度量空间

引文：

Zbl 1106.92307号
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{J.J.Nieto}等人，公牛。数学。生物学68，第3期，703--725（2006；Zbl 1334.92275）
全文： DOI程序

参考文献：

[1] DasGupta，B.，Jiang，T.，Kannan，S.，Sweedyk，E.，1998年。关于同步距离的复杂性和近似性。离散应用程序。数学。88, 59–82. ·Zbl 0928.68057号 ·doi:10.1016/S0166-218X（98）00066-3
[2] Engelking，R.，1977年。一般拓扑。华沙·Zbl 0373.54002号
[3] Foster，M.、Heath，A.、Afzal，M.，1999年。距离几何在序列关系船舶三维可视化中的应用。生物信息学15、89–90·doi:10.1093/bioinformatics/15.1.89
[4] Gusev，V.D.，Nemytikova，L.A.，Chuzhanova，N.A.，1999年。关于遗传序列的复杂性度量。生物信息学15，994–999·doi:10.1093/生物信息/15.12.994
[5] He，M.X.，Petoukhov，S.V.，Ricci，P.E.，2004年。遗传密码、汉明距离和随机矩阵。牛市。数学。生物学661405-1421·Zbl 1334.92273号 ·doi:10.1016/j.bulm.2004.01.002
[6] Hegalson，C.M.，Jobe，T.H.，1998年。模糊立方体和因果效应：中风伴随机制的表征。神经网络11，549–555·doi:10.1016/S0893-6080（97）00149-4
[7] Jamshidi，N.、Edwards，J.S.、Fahland，T.、Church，G.M.、Palsson，B.O.，2001年。人类红细胞代谢网络的动态模拟。生物信息学17，286–287·doi:10.1093/bioinformatics/17.3.286
[8] 姜涛，林庚，马乙，张凯，2002。RNA结构之间的一般编辑距离。J.计算。生物学9，371–388·doi:10.1089/10665270252935511
[9] Kosko，B.，1992年。神经网络和模糊系统。新泽西州恩格尔伍德悬崖普伦蒂斯·霍尔·Zbl 0755.94024号
[10] Li，M.，Badger，J.H.，Chen，X.，Kwong，S.，Kearney，P.，Zhang，H.，2001年。基于信息的序列距离及其在线粒体系统发育中的应用。生物信息学17149-154·doi:10.1093/bioinformatics/17.2.149
[11] Liben-Nowell，D.，2001年。关于共张力距离的结构。J.计算。生物学8，53–67·Zbl 1006.92023号 ·doi:10.1089/106652701300099092
[12] Lin，C.T.，1997年。径向基模糊系统的自适应子方法。收录：Kosko，B.（编辑），《模糊工程》，新泽西州上鞍河Prentice-Hall出版社，第429-464页。
[13] Morgenstern，B.，2002年。一种用于DNA和蛋白质序列比对的简单且节省空间的片段捕获算法。申请。数学。莱特。151, 11–16. ·Zbl 1015.92013年 ·doi:10.1016/S0893-9659（01）00085-4
[14] Nieto，J.J.，Torres，A.，2003年。模糊集的中点及其在医学中的应用。Artif公司。智力。医学17，81–101·doi:10.1016/S0933-3657（02）00080-5
[15] Nieto，J.J.，Torres，A.，Vazquez-Trasande，M.M.，2003年。研究多核苷酸之间差异的度量空间。申请。数学。莱特。27, 1289–1294. ·Zbl 1106.92307号 ·doi:10.1016/S0893-9659（03）90131-5
[16] Paun，Gh.，Rozenberg，G.，Saloma，A.，1998年。DNA计算：新的计算范式。柏林施普林格。
[17] Percus，J.，2002年。基因组分析数学。剑桥大学出版社，剑桥·Zbl 1018.92008年
[18] Sadegh-Zadeh，K.，1999年。临床方法学基础：第3卷。鼻科学。Artif公司。智力。医学17，87–108·doi:10.1016/S0933-3657（99）00015-9
[19] Sadegh-Zadeh，K.，2000年。模糊基因组。Artif公司。智力。医学18，1-28·doi:10.1016/S0933-3657（99）00032-9
[20] Tang，B.，2000年。评估一些DNA克隆策略。计算。数学。申请。3911, 43–48. ·Zbl 0947.92011号 ·doi:10.1016/S0898-1221（00）00106-1
[21] Torres，A.，Nieto，J.J.，2003年。模糊多核苷酸空间：基本性质。生物信息学195，587–592·doi:10.1093/bioinformatics/btg032
[22] Zaus，M.，1999年。超立方微积分的简洁和软计算。海德堡Physica-Verlag·Zbl 0921.68133号
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