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基于功能可靠性优化网络重构。 (英语) Zbl 1412.92131号

摘要:可靠的功能对于活细胞和生物体中遗传调控网络的生存和发展至关重要。这种功能可靠性是网络的一个重要特征,反映了通过进化嵌入监管网络的结构特征。在本文中,我们将这种可靠性集成到网络重建中。我们引入了依赖概率测量功能可靠性对网络边缘的依赖性。我们还提出了一种方法来估计依赖概率并选择对功能可靠性贡献较大的边缘。我们用芽殖酵母细胞周期调控网络和裂变酵母细胞周期调节网络这两个实际例子来证明,该方法改进了网络重构。此外依赖概率在计算上是鲁棒的,并且在实践中可以容易地实现。

理学硕士:

92立方厘米 系统生物学、网络
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全文: 内政部

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