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菲利普·甘贝特;文森特·贝里;克里斯托夫·保罗

水平-（k）系统发育网络的结构。 （英语） Zbl 1247.92018年9月

Kucherov，Gregory（编辑）等人，组合模式匹配。第20届年度研讨会，CPM 2009，法国里尔，2009年6月22日至24日。诉讼程序。柏林：施普林格出版社（ISBN 978-3-642-02440-5/pbk）。计算机科学课堂讲稿5577，289-300（2009）。
概述：进化通常被描述为一个系统发育树，但由于遗传物质的某些交换，它可以表示为一个具有潜在树结构的系统发育网络。最近，水平的概念被引入现实种类的系统发育网络中，作为一个参数来表示它们的复杂性和树相似性。我们研究了水平网络的结构，以及如何将其分解为水平生成器。我们还提供了一个多项式时间算法，该算法将水平-（k）生成器集作为输入，并构建水平-（k+1）生成器集。最后，通过模拟研究，我们评估了根据带重组的融合模型生成的网络中的水平-（k）系统发育网络的比例。
关于整个系列，请参见[Zbl 1165.68013号]。

引用于9文件

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第92天 与进化有关的问题
92立方厘米 系统生物学、网络
65年20月 数值算法的复杂性和性能

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\textit{P.Gambette}等人，Lect。注释计算。科学。5577，289--300（2009；Zbl 1247.92018）
全文： 内政部

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