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使用近似贝叶斯计算校准单相和双相肿瘤生长的基于代理的模型。 (英语) Zbl 1533.92053号

摘要:基于代理的模型(ABM)很容易用于捕捉肿瘤演化的随机性;然而,由于模型的复杂性,这些模型通常难以通过实验测量进行验证。基于Voronoi细胞的模型(VCBM)是一种基于非晶格代理的模型,它使用Voronoi镶嵌来捕捉单个细胞的形状,并模拟癌细胞增殖和运动的演变。有证据表明肿瘤在体内可以呈现双相生长。为了解释这一现象,我们扩展了VCBM来捕获两个不同生长阶段的存在。以前的工作主要集中在参数的点估计上,没有考虑估计的不确定性。本文采用近似贝叶斯计算对模型进行校准,以用于乳腺癌、卵巢癌和胰腺癌的体内测量。我们的方法包括估算控制癌细胞增殖的参数分布,并恢复与实验数据相匹配的输出。我们的结果表明,VCBM及其双相扩展提供了对肿瘤生长的洞察力,并量化了双相生长模型两个阶段之间切换时间的不确定性。我们发现这种方法能够精确估计子细胞成为成熟细胞所需的时间。这使我们能够对模型提出未来的改进,以提高准确性,同时也可以对癌细胞特征的差异做出结论。

MSC公司:

92立方 病理学、病理生理学
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
2015年1月62日 贝叶斯推断
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全文: 内政部

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