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程序性细胞死亡的数量性状基因座的非参数功能定位。 (英语) Zbl 1276.92027号

摘要:生物体的发育是一个复杂的动态过程,受基因网络和多种环境因素的控制。程序性细胞死亡(PCD)是一种生理性细胞自杀过程,发生在大多数生物体的发育过程中,通常是一种复杂的动态特征。理解基因如何控制这种复杂的发育过程一直是PCD研究中的一个长期主题。在本文中,我们提出了一个基于正交勒让德多项式的非参数模型,以映射控制PCD过程动态特征的基因或数量性状位点(QTL)。该模型是在基于最大似然的函数映射框架下建立的,并用EM算法实现。提出了一种通用信息准则,用于选择最适合PCD过程动态模式的最佳勒让德阶数。建立了订单选择准则的一致性。应用非平稳结构前相关模型(SAD)对不同时间点测量的表型之间的协方差结构进行建模。开发的模型对PCD过程的遗传控制机制进行了大量假设检验。为了研究模型的统计行为,进行了广泛的模拟研究。最后,我们将该模型应用于识别了几个QTL的水稻分蘖数数据集。所开发的模型为评估基因和发育性PCD过程之间的相互作用提供了一个定量和可测试的框架,并将对阐明PCD过程的遗传结构具有重要意义。

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92立方37 细胞生物学
92立方厘米 系统生物学、网络
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
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