安德鲁·奥克曼;马修·卡里埃;陈超;凯文·加德纳;劳尔·拉巴丹;拉米·万古里 基于持久同源性的乳腺癌免疫微环境表征：一项可行性研究。 （英语） Zbl 1518.92073号 J.计算。地理。 12，第2期，183-206（2021）. 摘要：持久同源性是拓扑数据分析的有力工具。主输出，持久性图，对给定数据集的几何和拓扑进行编码。我们提出了一种新的应用持久同源性来表征乳腺癌周围的生物环境，即肿瘤微环境。具体而言，我们将表征乳腺癌免疫微环境中免疫和恶性上皮（肿瘤）细胞的空间排列。通过从定量多重免疫荧光计算持久性图来建立定量和稳健的特征，这是一种允许我们获得单个细胞的空间坐标和蛋白质强度的技术。结果的持续性图被评估为预测癌症亚型和总生存率预后的特征性生物标记物。对于大约700名乳腺癌患者的队列，中位随访时间为8.5年，我们发现这些持续性图表优于并补充了常用的描述符，这些描述符通过最近邻分析捕捉空间关系。因此，我们的结果提出了新的方法，可用于构建基于拓扑的生物标记物，这些生物标记物具有癌症亚型、治疗反应以及总体生存预测的特征和预测性。 引用于1文件 理学硕士： 92 C50 医疗应用（通用） 55N31号 持久同源性及其应用，拓扑数据分析 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{A.Aukerman}等人，J.Compute。地理。12，编号2，183--206（2021；Zbl 1518.92073） 全文： 内政部