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亚历山大·巴拉班奇科夫;Jeremy Gunawardena

Goldbeter-Koshland循环树网络的单平稳性和多平稳性。 （英语） Zbl 1417.92053号

牛市。数学。生物。 81，第7期，2463-2509（2019）.
概述：系统生物学的一个主要挑战是在面对分子复杂性时获取一般属性。在这里，我们介绍了一类酶催化生化网络，并研究了单一正稳态（单稳态）的存在如何依赖于网络结构、酶机制、动力学速率定律和参数值。我们认为Goldbeter-Koshland（GK）共价修饰环排列在树型网络中，因此一个环中的底物形式可以是另一个环的酶。GK环路是细胞信号中的典型模体，树提供了线性级联的泛化，它适应了网络复杂性，同时保持了数学上的可控制性。特别是，它们允许使用更广泛适用的模块化递归证明策略。我们表明，如果每个酶在质量作用动力学下遵循其自身的复杂反应机制，那么对于所有适当的参数值，任何网络都是单稳态的。如果动力学是非质量作用，具有合理的单调性要求，并且每个酶都遵循迈克利斯·门顿机制，则保持单稳态。令人惊讶的是，在非质量作用单调动力学下，具有复杂酶机制的单个GK环可以具有多个正稳态（多稳态）。网络结构、酶机制和动力学之间更广泛的相互作用仍然是一个有趣的开放问题。

理学硕士：

92立方厘米 系统生物学、网络
92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等）

关键词：

生化反应网络;线性框架;Goldbeter-Koshland环路;非质量作用动力学;单调动力学;非迈克尔逊-曼顿反应机理;单稳态;多稳态

软件：

MESSI公司
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\textit{A.Barabanschikov}和\textit{J.Gunawardena}，公牛。数学。生物学81，第7期，2463-2509（2019；Zbl 1417.92053）
全文： 内政部

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