Satya Dandekar教授研究揭示了艾滋病毒在感染早期对肠道的直接破坏性影响。在短短几天到几周内，该病毒会破坏肠道上皮衬里并损害胃肠粘膜淋巴组织，这两种组织对于产生人体免疫反应以防御感染至关重要。胃肠道容纳了人体80%以上的淋巴组织。当肠道淋巴组织受到破坏和发炎时，它无法为宿主与病毒抗原的有效免疫相互作用提供功能平台，从而导致病毒不完全清除。在她进行里程碑式的研究，确定肠道在HIV感染和疾病进展中的关键作用时，在疾病早期开始抗HIV治疗并不常见。她的实验室是第一个显示在艾滋病毒感染早期启动抗逆转录病毒治疗的益处的实验室，它可以快速恢复免疫功能，更好地控制病毒感染。研究结果支持改变HIV治疗方案，在HIV感染早期开始抗HIV治疗，以获得更好的临床结果。当前研究调查正在开发新的策略来快速修复和恢复肠道上皮细胞和免疫细胞，以消除艾滋病毒的持久性。
