这个毒素和毒素靶点数据库(T3DB),或即将被称为有毒暴露物数据库是一种独特的生物信息学资源,它结合了详细的毒素数据和全面的毒素靶点信息。数据库当前包含3,67841602个同义词描述的毒素,包括污染物、农药、药物和食物毒素,与2073个相应的毒素目标记录相关联。总的来说,有42374种毒素与毒素靶点相关。每个毒素记录(ToxCard)包含90多个数据字段,包含化学性质和描述符、毒性值、分子和细胞相互作用以及医学信息等信息。此信息已从18143个来源,其中包括其他数据库政府文件、书籍和科学文献。

T3DB的重点是为每种毒素提供毒性机制和靶蛋白。T3DB的双重性质,其中毒素毒素目标记录在两个方向上相互关联,使其与现有数据库不同。它也是完全可搜索的,支持广泛的文本、序列、化学结构和关系查询搜索。它是根据人类代谢组数据库(HMDB)药物数据库T3DB的潜在应用包括毒素代谢预测、毒素/药物相互作用预测以及公众的一般毒素危害意识,使其适用于各个领域。总的来说,T3DB的多样性和可访问性使其成为普通用户和高级研究人员的宝贵资源。

引用T3DB:

  1. Wishart D、Arndt D、Pon A、Sajed T、Guo AC、Djoumbou Y、Knox C、Wilson M、Liang Y、Grant J、Liu Y、Goldansaz SA、Rappaport SM。T3DB:有毒物质暴露数据库。《核酸研究》,2015年1月;43(数据库问题):D928-34。25378312
  2. Lim E、Pon A、Djoumbou Y、Knox C、Shrivastava S、Guo AC、Neveu V、Wishart DS。T3DB:常见毒素及其靶点的综合注释数据库。《核酸研究》,2010年1月38日(数据库版):D781-6。19897546