为了补充南澳大利亚博物馆的研究兴趣，还通过捐赠、遗赠和收购的方式收集了文件。1800年代中期的科学家、传教士、土著组织、艺术家、警察督察、医生和摄影师都为博物馆档案中的知识财富做出了贡献。
南澳大利亚博物馆档案馆于20世纪40年代正式成立，当时人类学馆长，诺曼·丁代尔，认识到需要管理收藏并帮助检索。1966年，廷代尔的继任者格雷姆·普雷蒂（Graeme Pretty）通过添加将物品与档案联系起来的分类系统，进一步发展了现有系统。1980年，登记制度被记录组制度所取代，其中收藏品由收藏者或捐赠者附加。该系统目前仍在使用。
1940年之前的大多数公司记录都转移到了南澳大利亚州记录。许多存档集合仍未处理。