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PDBx/mmCIF格式(gz)
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PDB格式
PDB格式(gz)
PDBML/XML格式(gz)
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结构系数(CIF-gz)
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验证(XML-gz)
验证(CIF-gz)
生物组件1(CIF-gz)
生物组件2(CIF-gz)
生物组件1(PDB-gz)
生物组件2(PDB-gz)
地图系数(MTZ格式)
数据API
第6页
人内皮型一氧化氮合酶血红素结构域与4-((4-(2-氨基-4-甲基喹啉-7-基)-2-(氨基甲基)苯氧基)甲基苯甲腈的配合物的结构
X射线衍射
启动模型
初始优化模型
类型
来源
加入代码
细节
实验模型
PDB公司
4D1P型
结晶
结晶实验
身份证件
方法
酸碱度
温度
细节
1
蒸汽扩散,坐滴
7.5
277
0-12%PEG3350,0.1M BIS-TRIS
0.2-0.3M毫克醋酸盐,0.1M GdCl3
10%甘油,5 mM TCEP
晶体特性
马修斯系数
溶剂含量
2.69
54.3
Crystal数据
单位单元格
长度(Ω)
角度(˚)
a=60.539
α = 90
b=154.889
β = 90.8
c=109.18
γ = 90
对称
空间组
第1211页
衍射
衍射实验
ID编号#
水晶ID
散射类型
数据采集温度
探测器
探测器类型
细节
收款日期
单色仪
协议
1
1
x射线
100
CCD(电荷耦合器件)
ADSC量子315
后视镜
2017-07-19
M(M)
单波长
辐射源
ID编号#
来源
类型
波长列表
同步加速器站点
光束线
1
同步加速器
ALS梁线8.2.2
1
肌萎缩性脊髓侧索硬化症
8.2.2
数据收集
总体
身份证#
分辨率(高)
分辨率(低)
可能百分比(观察)
R合并I(观察)
R Sym I(观察)
Rpim I(全部)
CC(一半)
净I高于平均Sigma(I)
冗余
反射数(全部)
反射次数(观察)
观察标准Sigma(F)
观察标准西格玛(I)
B(各向同性)来自Wilson图
1
2.02
90
98.2
0.112
0.112
0.104
0.958
7.5
3.6
128858
-3
最高分辨率外壳
ID编号#
分辨率(高)
分辨率(低)
可能百分比(全部)
可能百分比(观察)
R合并I(观察)
R-Sym I(观察)
Rpim I(全部)
CC(一半)
Sigma上的平均值I(观察值)
冗余
唯一反射数(全部)
1
2.02
2.07
94.5
1.702
1.702
1.486
0.35
0.7
3.5
精炼
统计
衍射ID
结构求解方法
交叉验证方法
启动模型
分辨率(高)
分辨率(低)
反射次数(观察)
数字反射(R-Free)
反射百分比(观察)
R系数(观察值)
R工作
R自由
R-Free选择细节
平均各向同性B
X射线衍射
分子替换
自由R值
4D1P型
2.02
89.232
128413
12389
94.5
0.2009
0.1985
0.246
随机的
温度因子建模
各向异性B[1]
各向异性B[1][2]
各向异性B[1][3]
各向异性B[2]
各向异性B[2][3]
各向异性B[3]
RMS偏差
钥匙
细化约束偏差
f二面角d
14.126
f角度d
1.069
f _手性
0.063
f键d
0.01
f_平面_restr
0.006
精炼中使用的非氢原子
非氢原子
编号
蛋白质原子
12857
核酸原子
溶剂原子
757
异质原子
542
软件
软件
软件名称
目的
菲尼克斯
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